1. 囊胚培養及移植是最接近胚胎在自然成長中從輸卵管到子宮著床的各個階段的。
按照自然規律， 胚胎發育到4-8細胞的階段時是處於輸卵管中的。 當運動到子宮時， 胚胎發育成 囊胚並在那裡著床。 因此， 自然環境、營養物質和準備好的子宮內膜是囊胚階段的胚胎最佳環境。
2. 囊胚培養及移植可以選擇出最好的囊胚給患者移植。
如果移植2-8個細胞階段的胚胎， 我們無法得知胚胎移植到患者子宮後是否能夠繼續發育到囊胚階段並著床。
3. 囊胚培養可以初步進行胚胎篩選。
卵子或染色體異常的胚胎無法發育到囊胚階段，
4. 囊胚培養有助於在植入前進行胚胎基因診斷。
胚胎在植入前那一階段可以進行染色體異常的檢查和診斷， 並不影響懷孕。
5. 囊胚培養與移植有助於子宮準備好接受胚胎著床。
研究發現， 子宮在取卵當天會收縮並產生顯著痙攣。 這種症狀對被植入的胚胎是非常不利的， 因為胚胎可能會被排斥。 這些症狀可能會持續兩到三天， 之後逐漸減輕並在取卵後第四或第五條基本消失。 因此在囊胚培養的第5天植入囊胚讓子宮有足夠的時間恢復， 安全進行囊胚移植。
6.囊胚培養與移植可以降低多胎妊娠的幾率。
因為醫生會考慮只選擇一到兩個處於成熟階段的最好的胚胎進行移植。