土傳病害是影響蔬菜生產的主要問題， 其明顯特徵就是部分植株生長良好， 另一部分植株出現死棵現象。 按照死棵病害發生的部位，
1、苗期：莖基部病害為主
莖基部腐爛是造成番茄苗子死亡的主要原因， 占發病總量的八成以上。 番茄苗期莖基部病害主要有兩種， 包括疫黴根腐病、立枯病。 疫黴根腐病是造成番茄苗期大面積死棵最主要的病害種類， 主要由疫黴菌侵染造成， 發病較為迅速， 擴展速度快， 常常造成大面積死棵， 為害巨大。 立枯病是造成番茄苗期死棵的另一個主要病害， 主要由立枯絲核菌引起。
疫黴根腐病與立枯病的致病菌不同， 一個輸入卵菌， 一個屬於真菌， 其區別主要有兩點：一是立枯病發病部位失水幹縮， 病部明顯變細， 為幹腐症狀；而疫黴根腐病發病快， 雖然也有縊縮， 但幅度較小， 發病部位為濕腐症狀。
2、開花結果期：根部病害為主
越冬茬蔬菜死棵高發於2-3月份。 番茄生長前期大多較為正常， 但一到春節後， 氣溫上升， 死棵就開始發生， 嚴重的整棚拔園。 深冬季節蔬菜長期處於低溫、寡照的惡劣環境下， 而此時又是蔬菜價格最好的時間段， 大家留果多， 營養消耗大， 蔬菜植株“透支”嚴重， 根系衰弱， 抗病性很差。 到了春季溫度升高， 土壤病原菌開始活躍， 根部病害自然就會趁機爆發。
造成番茄根部腐爛的病害主要是根腐病， 其典型症狀為：一是主要發生在主根、較大的側根上；二是病株的根部皮層呈淡褐色及深褐色腐爛，
除了根腐病外， 枯萎病、青枯病等也會造成番茄死棵， 大家應根據發病症狀， 先判斷是哪種病害， 然後對症用藥。