在完成工程竣工驗收和開通試運營評審的基礎上， 經市政府批准， 南京地鐵S9號線（甯高城際二期）將於2017年12月30日開通試運營。 屆時，
S9號線（甯高城際二期）由S1號線（甯高城際一期）翔宇路南站高架接出，
S9號線（甯高城際二期）車輛採用“B2”型電動客車， 首次使用時速120公里的3輛編組列車。 此外， 甯高城際二期項目還首次採用LTE車地無線系統， 採用LTE作為城市軌道交通車地無線傳輸技術， 可保證列車高速行駛下列車監控資訊、多媒體資訊的高速率、高品質傳輸， 為改善南京地鐵乘客環境、提升運營安全與效率提供有利保障。
S9號線（甯高城際二期）車站裝修設計主體定位是“雅趣”， 全線車站造型通過現代的施工工藝和材料， 選取統一的江南民居特色的花窗和屋頂等江南古建築元素， 造型簡潔輕盈， 風格統一， 從遠處望去就像點綴在連綿青山和湖面旁的江南民居小屋， 很好的詮釋了“古韻•新城”這一設計理念。
根據協力廠商諮詢單位所做的客流預測， 開通初期， S9號線（甯高城際二期）日均客運量預計約0.98萬乘次， 日均出行量約0.57萬人次。 根據線路客流特點， S9號線運營服務時間為6:00-22:00， 開通初期將採用全大交路的運行模式， 單趟運營時間約36分鐘。 計畫在S9號線開通時， 同步將機場線運營時間由當前的6:00-22:00（南京南站-祿口機場）、6:40-22:00（祿口機場-南京南站）， 調整為雙向6:00-22:40。
據瞭解，S9 號線開通試運營後，地面公交線路將逐步新增配套20條，將有30條公交線路與甯高二期形成銜接。
線路換乘設在翔宇路南站每個車站均有自助充值設備S9號線（甯高城際二期）和S1號線（甯高城際一期）在翔宇路南站換乘，從高淳方向前往南京南站方向，以及從南京南站方向前往高淳方向的乘客，在翔宇路南站下車後在同月臺候車；從高淳方向去往祿口機場，以及從祿口機場前往高淳方向的乘客，在翔宇路南站下車後，需要通過電扶梯或樓梯，下至站廳，然後前往另一月臺換乘開往目的地方向的列車。換乘過程可留意車站標識和廣播，或諮詢現場工作人員。同時，每個車站均有自助充值設備，在高淳站設有市民卡綜合業務點。
據瞭解，S9 號線開通試運營後，地面公交線路將逐步新增配套20條，將有30條公交線路與甯高二期形成銜接。
線路換乘設在翔宇路南站每個車站均有自助充值設備S9號線（甯高城際二期）和S1號線（甯高城際一期）在翔宇路南站換乘，從高淳方向前往南京南站方向，以及從南京南站方向前往高淳方向的乘客，在翔宇路南站下車後在同月臺候車；從高淳方向去往祿口機場，以及從祿口機場前往高淳方向的乘客，在翔宇路南站下車後，需要通過電扶梯或樓梯，下至站廳，然後前往另一月臺換乘開往目的地方向的列車。換乘過程可留意車站標識和廣播，或諮詢現場工作人員。同時，每個車站均有自助充值設備，在高淳站設有市民卡綜合業務點。