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一、軍醫的設立
《太平御覽》載晉朝劉德“官至太醫校尉”， 《資治通鑒·晉紀》中記有武帝時程據為太醫司馬，
北魏延昌元年（512年）， “肆州地震陷裂， 死傷甚多”， 世宗下詔說：“亡者不可複追， 主病之徒， 宜加療救， 可遣太醫、折傷醫， 並給所須之藥就治”（《魏書·過宗紀》）。 以上太醫校尉、太醫司馬、金瘡醫和折傷醫,可能都是當時的軍醫。
兩晉南北朝時， 帝王及將帥出征， 也多派遣太醫， 或有侍醫跟隨。
二、士卒的體檢
歷史上明文記載由醫生對徵募入伍士兵進行體檢， 首推齊東昏候蕭寶卷在位之時以（499－501年）。 《南史·齊本紀下》敘述其役政的腐敗情形：“自永元（499年）以後,魏每來伐， 繼以內難， 楊、南徐二州人丁， 三人取兩，
三、有關軍隊多發病及流行病的記載
疾病對於人類生命的威脅， 往往超過戰爭的殺傷力。 戰爭中遠行征伐， 風餐露宿，
《魏書， 武帝紀》中也記載：“公（曹操）至赤壁， 與（劉）備戰不利。 於是大疫， 吏士多死者， 用引軍還”。 這裡更把“大疫”作為曹軍敗還的第一位原因， 赤壁大戰之後半年， 曹操在第一項軍令中說：“自頃以來， 軍數征行， 或遇疫氣， 吏士死亡不歸， 家室怨曠， 百姓流離”（同上）。
在這一時期內， 歷史上所載戰時多發病及流行病， 大致有以下幾類：
（一）疫及大疫
北魏道武帝于皇始元年（396年）親率“六軍四十余萬”， 南下討慕容寶，
（二）瘧疾、瘴氣
梁武帝時（502～549年）， 殷鈞任明威將軍， 臨川內史， “郡舊多山瘧， 更暑必動， ……， 郡境無複瘧疾”（《梁書·殷鉤傳》）。
和平元年（460年）八月， 魏文成帝拓拔睿行幸河西， “西征諸軍至西平， 什寅走保南山”“九月， 諸軍濟河追之， 遇瘴氣， 多有疫疾， 乃行軍還”（《魏書·高宗紀》）。
（三）虜瘡（天花）
葛洪《肘後方》所載之“虜瘡”， 說明天花在我國之流行乃由部隊傳播。
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四、創傷的診斷和治療
魏晉南北朝時期， 實踐醫學的發展， 使金創折瘍的臨證經驗得到積累和發展。
《肘後方》介紹了危重創傷的早期處理， 描寫了顱腦損傷和外傷可導致大出血致死的部位。 《外台秘要》卷20“金瘡禁忌序”中引葛洪“凡金瘡出血， 其人若渴，當忍之。常用乾食並肥脂之物以止渴，慎勿鹹食，若多飲粥葷，則血溢出殺人，不可救也。又忌嗔怒大言笑，思想陰陽，行動作勞。勿多食酸鹹，飲食酒、熱羹臛輩，皆使瘡腫痛發，甚者即死。現代對創傷休克及出血性休克的處理，仍然採取這些措施。葛洪認為：“凡金瘡，傷天囟、眉角、腦戶、臂裡跳脈（肱動脈）、髀內陰股（股動脈）、兩乳上下、心、鳩尾，小腸及五藏之腑輸（位於胸背，去脊柱三橫指）皆是死處，不可療也”顱腦損傷、肱或股大動脈出血不止，或內臟破裂，肋骨骨折所致的氣血胸等證候，對現代醫學來說也是嚴重的戰傷。
劉宋時龔慶宣整理的《劉涓子鬼遺方》是中國在癰疽金瘡方面論述較詳的第一本方書。劉涓子曾隨宋武帝劉裕北征，在軍中以善治金瘡癰疽聞名。全書共載方140餘首，其中治金癰疽方有34首。他還提出：如被有射網的毒箭所傷，可用蘭子散解毒。如箭在肉中不出，可用半夏和白蘞下篩，以酒服。並說：“淺者十日出，深者二十日，終不住肉中”。
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其人若渴，當忍之。常用乾食並肥脂之物以止渴，慎勿鹹食，若多飲粥葷，則血溢出殺人，不可救也。又忌嗔怒大言笑，思想陰陽，行動作勞。勿多食酸鹹，飲食酒、熱羹臛輩，皆使瘡腫痛發，甚者即死。現代對創傷休克及出血性休克的處理，仍然採取這些措施。葛洪認為：“凡金瘡，傷天囟、眉角、腦戶、臂裡跳脈（肱動脈）、髀內陰股（股動脈）、兩乳上下、心、鳩尾，小腸及五藏之腑輸（位於胸背，去脊柱三橫指）皆是死處，不可療也”顱腦損傷、肱或股大動脈出血不止，或內臟破裂，肋骨骨折所致的氣血胸等證候，對現代醫學來說也是嚴重的戰傷。劉宋時龔慶宣整理的《劉涓子鬼遺方》是中國在癰疽金瘡方面論述較詳的第一本方書。劉涓子曾隨宋武帝劉裕北征，在軍中以善治金瘡癰疽聞名。全書共載方140餘首，其中治金癰疽方有34首。他還提出：如被有射網的毒箭所傷，可用蘭子散解毒。如箭在肉中不出，可用半夏和白蘞下篩，以酒服。並說：“淺者十日出，深者二十日，終不住肉中”。
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