1646年， 南明弘光和隆武政權相繼滅亡， 桂王朱由榔隨之在廣東肇慶登基， 改元永曆， 後來在大西軍首領李定國的支持下， 移至昆明。 1659年， 清軍攻陷昆明， 永曆帝再次敗逃， 這一跑就跑到了緬甸。
倉皇入緬遭繳械
選擇逃亡緬甸， 永曆帝的權臣馬吉翔起了重大作用。 馬吉翔靠偷奸取巧、拍馬奉迎贏得了李定國歡心。 昆明陷落前， 朝臣大多主張遷往四川， 永曆帝也贊同這一主張， 但馬吉翔認為一旦入川， 李定國將被袁宗第、郝永忠等大順軍將領分權。 故而聯合李定國親信勸說李定國西撤， 致使永曆帝不得不向中緬邊境撤退。 馬吉翔認為只要進入緬甸國境就可以保住身家性命， 不惜趁夜鼓動士兵判亂， 逼永曆帝入緬。 在馬吉翔鼓動下， 當晚， 在夜色籠罩之下亂兵大肆擄掠， 永曆帝受此驚嚇， 急忙渡過曩本河， 到達緬關。 守關士兵得知有近兩千人馬隨永曆帝避難緬甸，
永曆帝及其隨從歷盡艱辛抵達緬甸都城阿瓦後， 便立即派人前往緬都與緬王接洽。 但是緬王拒絕接見流亡朝廷的使者， 只派漢人從中傳達資訊。 後來， 為了便於監視永曆帝及其隨從， 緬王令人在阿瓦城隔河對岸用竹子圍造了一座城， 讓永曆君臣居住。
寄人籬下遭咒水之難
暫時有了安身之地， 永曆君臣開始了寄人籬下的生活。 然而習慣了紙醉金迷的南明朝臣不幾日便故態復萌， 不圖進取， 苟且偷安。 當時緬民到永曆君臣住地進行貿易， 不少南明官員與緬婦調笑諧謔， 遭到一些緬人的鄙夷， 說朝廷的大臣都這個德行， 天朝也是氣數將近了。 隨永曆帝入緬的朝臣一味享樂， 毫無共赴國難之心， 永歷朝廷由此愈發窘困， 滅亡已是遲早的事了。
順治十八年（1661）五月二十三日， 緬王的弟弟莽白發動宮廷政變， 處死緬王自立。 新王派使者向永曆帝索取賀禮， 此時的永曆帝已拿不出像樣的東西，
莽白決定剷除永曆隨行官員， 派人通知永歷朝臣過江議事。 鑒於雙方關係緊張， 南明文武官員心懷疑懼都不敢前往。 緬王又遣人來說， 此去只是緬王邀請群臣飲咒水盟誓， 以增強雙方的信任，
次日， 馬吉翔及其他大小官員參加飲咒水盟誓。 文武官員一到達盟誓地點就遭到緬兵攻擊， 被騙來飲咒水的官員全部遇難， 自以為入緬便可保安全的馬吉翔也丟了性命。
緬軍隨即突入永曆君臣住所， 把永曆帝、太后、皇后、太子等25人集中於一所小屋內。 永曆帝的劉、楊二貴人， 吉王與妃妾等百餘人大都自縊而死。 為防永曆帝自盡， 緬王又遣人前來撫慰， 送來一些生活用品， 倖存人員方得苟延殘喘。 咒水之難後， 永曆帝真正成了孤家寡人， 永歷朝廷實際已不存在。
孤家寡人仍難逃一死
永曆帝留在緬甸，終究是一個禍患。1660年，吳三桂幾次上疏清廷，力主入緬進討，清廷採納了吳三桂的意見，派出八旗兵由北京前往雲南，會同吳三桂一起進兵緬甸，捉拿永曆帝。
隨著清政權的逐步穩固，緬甸政府也不願為收留南明流亡政權而得罪中國的實際統治者。李定國等明朝將領為迎回永曆帝一再與緬方兵戎相見，清軍又將入境進討，使得緬甸政府不得不為本國的安全考慮。順治十八年（1661）正月初六，緬王派使者到雲南，提出以交出永曆帝為條件請清軍合攻李定國。吳三桂立刻答應了緬方的請求。咒水之難後，新緬王實際上把永曆帝當作與清廷討價還價的籌碼。
順治十八年（1661）八月二十四日，吳三桂率兵由昆明分兩路西進。不久，清軍迫近緬都，緬王派人將永曆帝及其隨從移交給清軍。吳三桂隨即撤出緬境。
康熙元年（1662）三月，永曆帝及其眷屬被押回雲南昆明。吳三桂認為若押解回北京，路途十分遙遠，擔心發生意外，建議就地處決，清廷准奏。四月，永曆帝被處死。南明永歷朝廷至此煙消雲散。
永歷朝廷實際已不存在。
孤家寡人仍難逃一死
永曆帝留在緬甸，終究是一個禍患。1660年，吳三桂幾次上疏清廷，力主入緬進討，清廷採納了吳三桂的意見，派出八旗兵由北京前往雲南，會同吳三桂一起進兵緬甸，捉拿永曆帝。
隨著清政權的逐步穩固，緬甸政府也不願為收留南明流亡政權而得罪中國的實際統治者。李定國等明朝將領為迎回永曆帝一再與緬方兵戎相見，清軍又將入境進討，使得緬甸政府不得不為本國的安全考慮。順治十八年（1661）正月初六，緬王派使者到雲南，提出以交出永曆帝為條件請清軍合攻李定國。吳三桂立刻答應了緬方的請求。咒水之難後，新緬王實際上把永曆帝當作與清廷討價還價的籌碼。
順治十八年（1661）八月二十四日，吳三桂率兵由昆明分兩路西進。不久，清軍迫近緬都，緬王派人將永曆帝及其隨從移交給清軍。吳三桂隨即撤出緬境。
康熙元年（1662）三月，永曆帝及其眷屬被押回雲南昆明。吳三桂認為若押解回北京，路途十分遙遠，擔心發生意外，建議就地處決，清廷准奏。四月，永曆帝被處死。南明永歷朝廷至此煙消雲散。