秦始皇“坑儒”的故事原型見於《說苑》卷二十《反質》講方士侯生、盧生害怕繼續留在秦始皇身邊會遭殺戮， 於是一起逃跑， 始皇聞之， 大怒曰：吾異日厚盧生， 尊爵而事之， 今乃誹謗我， 吾聞諸生多為妖言， 以亂黔首， 乃使禦史悉上諸生， 諸生傳相告， 犯法者四百六十餘人， 皆坑之。
假如秦始皇真的坑殺了儒生四百六十餘人，
那麼秦朝滅亡後，
漢朝初期的儒生們肯定有人會講述這件事，
但是漢初儒學鉅子賈誼，
他寫的那篇膾炙人口的政論文《過秦論》，
專門批判秦始皇的過失。
《過秦論》裡面說秦始皇：廢先王之道， 焚百家之言， 以愚黔首， 隳名城殺豪傑， 收天下之兵據之咸陽， 銷鋒鏑， 鑄以為金人十二， 以弱天下之民， 文中說了“焚書”， 卻根本沒提及“坑儒”的事。
這些事實不能不令我們對秦始皇坑儒說法的真實性產生疑問， 其實秦始皇坑殺的不是儒生， 而是裝神弄鬼的方士， 秦始皇求仙養了大批的方士， 但所謂的不似仙丹都是方士用來騙取錢財的謊言。
時間久了， 盧生、侯生等方士怕謊言揭穿而被治罪， 因此叛逃， 同時誹謗秦始皇， 於是很多方士外逃， 這才引出了坑殺事件。