說起抗日戰爭時期日軍在中國境內設立的細菌戰部隊， 大家首先就會想到在哈爾濱的731部隊。 然而， 除了臭名昭著的731部隊之外， 日軍在中國境內其實還有四支鮮為人知的細菌戰部隊。
100部隊前身是日本關東軍臨時病馬收容所， 1931年在瀋陽成立， 1933年搬遷至長春。 病馬收容所成立之初， 主要是為關東軍的軍馬防治馬疫。
1933年4月， 齊齊哈爾市附近流行馬的炭疽病， 日本懷疑這是是蘇聯秘密發動的細菌戰。 於是， 關東軍獸醫部指令病馬收容所成立畜類細菌戰研究室。 這與731部隊的成立幾乎同時， 731部隊是1932年在中國東北成立， 1933年在哈爾濱背蔭河建成“中馬城”細菌實驗場。
1936年8月1日， 關東軍正式設立軍馬防疫廠， 1941年蘇德戰爭爆發後， 該部隊改用秘密番號“第100部隊”。
100部隊研製的細菌武器主要是針對牲畜和農作物的， 也有作為謀略武器的植物性毒藥。 100部隊在研製細菌武器過程中，
1945年8月， 蘇聯遠東軍出兵東北， 關東軍下令銷毀細菌戰痕跡。 100部隊被解散， 人員撤退到朝鮮， 長春孟家屯100部隊基地被迅速摧毀。
該部隊全稱日本華北派遣軍“北支”（甲）1855部隊， 由於隱藏極深， 日本投降時有足夠時間銷毀罪證， 造成世人對其內情和罪惡都很少瞭解， 其主要成員也都喬裝打扮逃回日本國內。
1937年七七事變後， 日軍侵佔北平後， 強佔了天壇公園西南角原國民黨中央防疫處生物製品所， 開始籌建細菌戰基地“華北派遣軍防疫給水部”。
1855部隊總人數1500人， 除北平總部外， 天津、太原、濟南、石家莊、張家口、鄭州、開封、青島、包頭、徐州等城市都有其分支機搆。
1855部隊與731部隊一樣， 都犯下了對人體進行細菌和解剖在實驗的罪行， 只不過在華北地區的廣大城鄉， 這種罪行更加隨意和喪心病狂。 1855部隊把“當作動物做實驗”的活人稱為“猿”， 時常在華北進行“掃蕩”和製造“無人區”時，
從七七事變到抗戰勝利的8年間， 1855部隊在華北地區散播霍亂、鼠疫、傷寒等細菌約70次， 造成大量中國軍民傷亡。
8604部隊直屬于侵華日軍“南支那派遣軍”， 1938年9月， 該部隊前身在日本國內編成。
8604部隊在廣州的駐地是當時中山大學的醫學院， 中山大學醫學院有現成的實驗室、化驗室、解剖室、教學室， 十分適合作為細菌戰基地。
8604部隊配備1200人， 除廣州本部外， 在廣東、福建、廣西、香港等地都有支部。 8604部隊的第三任部隊長佐藤俊二在1930年代初與731部隊部隊長石井四郎同在日本陸軍軍醫學校擔任教官， 此人後來又調任另外一支日軍在華中地區的細菌戰部隊1644部隊擔任部隊長。
由於資料稀少， 8604部隊是侵華日軍五大細菌戰部隊裡， 罪惡面貌被揭露最不充分的一支部隊。 史學界一直懷疑福建鼠疫、廣西霍亂、東莞天花大流行與8604部隊有關。
1937年，南京陷落，731部隊部隊長石井四郎開始以南京為基地，進一步擴大細菌戰的研究網路。
1939年4月18日，榮字1644部隊成立，對外名稱叫“中支那防疫給水部”，石井四郎同時兼任1644部隊首任部隊長。
1644部隊本部設在南京中央陸軍醫院，在上海、蘇州、常州、杭州、九江、南昌、安慶、漢口等地設立了12個分部，總部與各分部的工作人員總數達1500多人。731部隊主要生產化學毒氣，而1644部隊則側重霍亂、鼠疫等細菌生物試驗，研究、生產大量鼠疫跳蚤是他們的特長。
1644部隊除在動物身上做實驗外，還進行了慘無人道的活人試驗。活體的來源主要是戰俘，當時大多數是從老虎橋監獄獲得。當時駐南京的日軍部隊也極少知道1644部隊的真相，被抓去作試驗的人更沒有一個能活著出來。
1644部隊的細菌生產能力十分驚人，日軍投降後，將南京這家細菌戰劑生產廠尚存的細菌培養原料——瓊脂、蛋白腖和牛肉膏等約數十噸運回上海江灣的國防醫學院，竟裝了十節火車廂，國防醫學院又將這批原料轉給上海生物製品所應用，據說用了十多年還未用完。
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