您的位置:首頁>正文

中國種茶樹全基因組獲解密

本報訊安徽農業大學茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室(安徽省實驗室)宛曉春教授研究團隊, 聯合深圳華大基因和中國科學院國家基因研究中心(上海)等相關研究團隊, 破解了世界上分佈最廣的中國種茶樹的全基因組資訊, 相關成果4月21日線上發表於美國《國家科學院院刊》。

世界主栽茶樹分屬兩個變種: 中國種和阿薩姆種, 前者葉小, 分佈廣, 適制綠茶等六大茶類;後者葉大, 主要分佈在熱帶和冬季溫暖的亞熱帶地區, 適制紅茶和普洱茶。 研究團隊以國家級茶樹品種舒茶早(中國種)為材料,

用二代和三代測序技術對其進行測序, 採取雜合組裝策略, 獲得覆蓋基因組93%區域的高品質序列草圖, 注釋出33932個高可信度的茶樹基因。

結果顯示, 中國種基因組大小為3.1Gb, 重複序列含量為64%, 基因組組裝的完整性和品質遠高於現有同類已測序物種組裝水準。 研究發現, 茶樹祖先種大約在8000萬年前與親緣關係最近的獼猴桃物種發生分化, 繼而在154~38萬年前, 又分化形成中國種和阿薩姆種。

研究發現, 茶樹基因組發生過兩次全基因組複製事件, 最近一次發生在4000~3000萬年前, 該事件及後續串聯複製導致了與兒茶素類物質和咖啡鹼生物合成相關的基因拷貝數顯著增加。 而兒茶素的生物合成受到複雜的轉錄調控, 許多與生物逆境和非生物逆境相關的轉錄因數都與兒茶素含量高度相關。

研究發現了一個參與茶氨酸合成的關鍵酶基因(CsTSI), 並通過轉錄組學和轉基因分析, 證明CsTSI具有合成茶氨酸的酶活性。 比較基因組分析發現, 萜烯類等物質的合成酶基因拷貝數在茶樹基因組中也發生顯著擴增, 有助於解釋茶葉獨特的香氣。 這些發現首次從基因組層面系統解開了茶葉中富含獨特的風味物質之謎。

《中國科學報》 (2018-04-26 第1版 要聞)

同類文章
Next Article
喜欢就按个赞吧!!!
点击关闭提示