近親結婚的習俗由來已久， 西方的創世紀中就記載有兄妹通婚， 我們東方傳說的伏羲和女媧還是兄妹結婚繁衍後代的。 雖然我國古代都曾規定有同姓不通婚的， 但是由於自古以來我國婚姻要求的就是門當戶對， 在古代其實就是士庶不婚， 良賤不婚， 因此士族間多以彼此通婚的方式保證權勢的穩固和延續， 難免就存在親上加親， 造成子孫後代身體贏弱的嚴重後果。
而在國外， 曾經統治過大半個歐洲的哈布斯堡家族， 就因為近親結婚而造成子嗣斷絕。 因此， 我國清朝曾規定禁止中表婚， 可是由於女真人的婚俗習慣以及愛新覺羅家族本身的通婚標準， 而導致形同虛設。
努爾哈赤建立了後金政權， 雖然地位有提高， 但是仍舊延續女真的婚俗習慣， 女人在女真部落就是聯姻的工具。 因此父死子繼， 兄終弟及。 在努爾哈赤死後， 就把大福晉留給了大兒子代善。
從努爾哈赤開始拉攏蒙古而進行最常見的聯姻後， 多爾袞和侄子豪格同時娶了蒙古族的博爾濟吉特氏的姐妹倆， 而皇太極更是連娶了五個博爾濟吉特氏， 一後四妃中的其中三個是親姑侄仨。 其中就包括順治帝的母親， 後來尊稱為孝莊文皇后。
順治即位後， 孝莊為順治連娶了三個博爾濟吉特氏的皇后， 前兩個是孝莊的親侄女， 順治的親表妹。 最後一個是孝莊的侄孫女， 順治的外甥女。 而從皇太極開始， 為了加強與蒙古部落的聯繫， 更是把皇室女兒多數加入蒙古部落。 特別是科爾沁部， 此後滿蒙之間血脈混合。
而順治入關後， 受中原文化中封建倫理道德的影響， 而對近親通婚予以限制， 可是這對清朝皇室沒有任何作用。 康熙就同時娶了佟國維的姐姐和女兒。 而滿蒙通婚和愛新覺羅氏在滿族內部通婚的規定， 導致了愛新覺羅男性子嗣逐漸稀少。
到了咸豐皇帝， 只有同治一個親生子， 而同治19歲未留下血脈就去世了。 在同治去世後， 慈禧立了咸豐的弟弟和慈禧的親妹所生的兒子光緒為皇帝， 而光緒的皇后隆裕是慈禧的親弟弟的女兒， 也就是說光緒娶了小姨家的女兒， 他的親表妹。 而清朝滅亡之後， 也就沒有了所謂的皇室， 愛新覺羅可以自由結婚， 現存人口也不過一二萬人。