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1.過量鐵質積聚。
長期輸血會造成鐵質沉積， 而過量鐵質的積聚會對多個器官造成破壞， 主要受影響的包括心臟、肝臟、胰臟和各個內分泌器官， 病者會出現心臟衰竭、肝硬化、肝功能衰退、糖尿， 以及因為多種內分泌失調， 而變得身材矮小和發育不全等等。
2.輸血引起的反應。
常見輸血時引起的不良反應， 包括發熱、發冷和出紅疹等， 較嚴重的反應， 如急性溶血氣管收縮和血壓下降等， 雖然甚少出現但絕不能忽視。
3.經輸血而傳染的疾病。
經輸血而傳染的主要是過濾性病毒疾病雖然在輸血整個過程中多重的預防措施， 已把傳染的機會減至極少， 偶然亦有因輸血而感染丙型和乙型肝炎的例子， 至於愛滋病毒的傳染， 可說是極為罕見， 以上三種病毒中只有乙型肝炎可以靠有效的疫苗預防。