長沙方面對曾國藩已無可指摘， 反而漸漸萌生敬重之心。 但中央政府方面卻給了曾國藩幾記響亮的耳光。
湘潭大捷後， 駱秉章要上報朝廷， 曾國藩阻止。 他說：“你報湘潭大捷， 那就要報靖港之敗， 不能只報喜不報憂。 ”駱秉章慌忙把這個差事推給曾國藩說：“那你來報吧， 況且仗也是你打的。 ”
曾國藩這一招叫暗度陳倉， 駱秉章是湖南巡撫， 在湖南發生的任何事只有他有權力上報， 特別是戰事。 曾國藩現在是把上報的權力悄無聲息地奪到了自己手上， 他以為這次能壟斷向上彙報的資訊管道， 但是他想錯了。
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曾國藩向咸豐上書說：“這次在湖南的兩場惡戰， 可謂驚心動魄， 實在讓我大感意外。 湘潭之戰完敗長毛賊， 可恨的是靖港之戰卻顆粒無收， 我深知有罪， 請皇上治我罪。 ”
咸豐皇帝拿到曾國藩的上書， 皺眉不解。 他有點看不明白， 於是問身邊的人：“曾國藩向來標榜誠意，
有人站出來說：“前段時間風傳， 曾國藩以一在籍紳士， 短短時間就湊齊了一支軍隊， 可見能力強大， 志氣也不小。 如今他打了這樣大一個勝仗， 咱們要小心啊。 ”
咸豐皇帝“呸”了那人一口：“你這種人真是犯賤， 羡慕嫉妒恨， 搬弄是非， 見不得別人好。 曾國藩能有什麼別的心？不過他這封信倒是很不誠意， 他是否有罪， 我做皇帝的說了算。 他憑什麼耍這種小聰明？！”
咸豐耍起小聰明來比曾國藩厲害十倍， 所以他採取“大棒加胡蘿蔔”來對付曾國藩。 他必須要讓曾國藩知道， 在他面前耍小聰明是自尋死路。 做他咸豐的臣子， 無論你有多能耐， 老實本分、以誠為本是基礎。
第一大棒：下旨訓斥曾國藩，
第二大棒：你既然有自知之明， 說自己有罪， 那我就革了你的禮部侍郎職務， 趕緊戴罪立功， 剿滅叛匪。
第三大棒， 最嚴厲。 咸豐把曾國藩的手下塔齊布升為湖南提督， 統轄湖南全省軍隊， 這無疑是把塔齊布淩駕到了曾國藩之上。
慶倖的是， 塔齊布從無二心， 始終聽命于曾國藩。
揍了曾國藩三大棒後， 咸豐又給了曾國藩一根胡蘿蔔：朕賞你獨立奏事的權力， 你要珍惜， 不可等閒視之。
事到如此， 曾國藩哪裡還敢等閒視之。 他上奏疏說， 自己感激得鼻涕一把淚一把， 發誓必殲太平軍， 保衛大清江山萬年不倒。
和咸豐皇帝過招之後， 曾國藩把注意力集中到湘軍上。 他認真總結了嶽州、靖港和湘潭三次戰役的經驗教訓， 最終認定失敗的根本原因是功罪不清、賞罰不明。 要扭轉這種情況， 必須從明晰賞罰、嚴肅軍紀做起。
曾國藩一想到在靖港之戰中，
留下來的都是敢打敢拼的士兵， 曾國藩又對他們進行思想政治教育， 讓他們知道世上的確有軍紀這回事。 如果你不拿軍紀當回事， 那我曾國藩就不把你們的命當回事。 你們既然想在湘軍中闖出一片天下， 那就必須唯我曾國藩馬首是瞻。 要想追隨我曾國藩升官發財的， 必須為我賣命， 不允許任何人濫竽充數。
同時， 曾國藩注意到了自己的弱點， 那就是優於謀劃， 拙于指揮。 所以他在指揮系統上做了很大的改革。從前，湘軍的編制最高一級為營，曾國藩直接指揮營。現在，營以上設立統領，統帥兩營或數營。這些統領就是團長、旅長。有了這樣的編制，使得湘軍的兵力更容易集中，容易適應戰陣形勢的變化。
最後，曾國藩花大價錢購買了更多的西洋炮。在湘潭之戰中，正是因為西洋炮的威力才取得了勝利，曾國藩自此後深深地迷戀上了大炮，這也是湘軍後來能擊敗太平軍的一個重要的技術原因。
經過一番翻天覆地的整頓後，曾國藩的湘軍脫胎換骨，這就是長沙整軍，它是湘軍貨真價實成為一支軍隊的開始，也是曾國藩逐夢的開始。
然而，天將降大任于曾國藩，非和他作對不可，必要苦其心志勞其筋骨餓其體膚，讓他咬牙切齒找不到北。
曾國藩接下來的命運，坎坷得使人忍不住要為他哭盡一生的淚水。
所以他在指揮系統上做了很大的改革。從前，湘軍的編制最高一級為營，曾國藩直接指揮營。現在，營以上設立統領，統帥兩營或數營。這些統領就是團長、旅長。有了這樣的編制，使得湘軍的兵力更容易集中，容易適應戰陣形勢的變化。最後，曾國藩花大價錢購買了更多的西洋炮。在湘潭之戰中，正是因為西洋炮的威力才取得了勝利，曾國藩自此後深深地迷戀上了大炮，這也是湘軍後來能擊敗太平軍的一個重要的技術原因。
經過一番翻天覆地的整頓後，曾國藩的湘軍脫胎換骨，這就是長沙整軍，它是湘軍貨真價實成為一支軍隊的開始，也是曾國藩逐夢的開始。
然而，天將降大任于曾國藩，非和他作對不可，必要苦其心志勞其筋骨餓其體膚，讓他咬牙切齒找不到北。
曾國藩接下來的命運，坎坷得使人忍不住要為他哭盡一生的淚水。