1.降低熱效率
由於水垢比金屬的導熱係數小幾百倍。 因此， 即使在受熱面上形成不太厚的水垢， 也會因為熱阻大， 使其導熱效率降低，
受熱面上結有水垢， 會使金屬管壁局部過熱， 當壁溫超過其工作允許極限溫度時， 就會使其局部鼓包， 這種現象多發生在電加熱管上， 也是致使電加熱管損壞的主要原因之一。
2.降低迴圈量
太陽能熱水器真空管內結垢後， 流通截面積減少， 增加了水迴圈的速度和流動阻力致使升溫效果明顯下降。
3.降低使用壽命
水垢附在真空管內， 很難清除。 為了除垢需要經常清洗， 因而增加檢修次數， 費時費料費財。 而且可能由於除垢方法不當而降低使用壽命。
4.腐蝕金屬內壁
水垢是一種複雜的鹽類， 其中含有鹵素離子， 在高溫下對鐵有腐蝕作用。 通過對鐵質水垢的分析， 可知它含鐵量達20～30%左右。 水垢的侵蝕會使金屬內壁變脆並不斷向深處腐蝕。
5.使感測器失效
水垢的導熱係數低， 一旦結垢， 感測器內部的感溫元件不能及時感應到外部水溫的變化， 使得顯示的溫度比實際水溫要低。
因為水垢的特性， 使得水位顯示出現偏差。 這個過程一般有兩種現象：一種是結垢初期水垢稀鬆似海綿狀， 這時的水垢能吸收水份， 即使水箱內只有少量水也會因為毛吸現象而顯示滿水位;另一種是結垢後期水垢堅硬、緻密， 由於水垢阻礙了電信號的傳送， 水箱內就是注滿水也會顯示缺水或無水。
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