有台媒指出， 賴清德直言敢沖， 從不避諱個人“台獨”傾向。 今年5月， 他出人意表在台南市議會說自己“親中愛台”， 訪美時又發表“廢除‘台獨’黨綱不是問題、接受‘九二共識’也不是問題”談話， 引發社會很大的爭議。
對於台南市長賴清德將接任台行政機構負責人， 其鮮明的“台獨”立場是否影響兩岸關係走向？
北京聯合大學台研院兩岸關係所所長朱松嶺， 資料圖；
大陸方面涉台專家朱松嶺6日指出， 蔡英文在交接典禮上交代給賴的七項主要任務中， 沒有兩岸， 形同給賴設下限制。 他認為， 賴未來若想挑戰領導人大位， 就更需謹慎處理兩岸關係， 未來可能會儘量避免直接就兩岸表態， 但因賴在意識形態上的“慣性”， 仍不能排除未來會出現“偏獨”的政策。
針對賴清德接任台行政機構負責人， 北京聯合大學台研院兩岸關係所所長朱松嶺6日受訪指出， 他仔細看了蔡英文在記者會上的講話， 她交給賴的七大任務中， 並沒有提到兩岸， 相當於為賴“畫了個圈”， 目前看賴清德更像是個“執行長”， 目標是要將各項改革落實到底。
朱松嶺說， 台行政機構負責人的位子， 在臺灣的政治發展史上猶如“消耗品”， 做得好是領導人制定方針政策正確，
朱松嶺還指出， 臺灣政壇任何人想謀求更高位置， 都必須將兩岸關係處理好， 如果太偏向“台獨”， 美國和臺灣民眾都不會放心， 大陸更不會接受。 因此， 他分析賴清德上任後， 會儘量避免對兩岸關係直接表態或發表過激言論， 但由於其根深蒂固的“台獨”意識形態所帶來的“慣性”， 在推動政策上， 仍有“傾獨”的可能。
對此， 臺灣《中國時報》則指出， 蔡賴二人應認識到北京對“蔡賴體制”的負面解讀或產生很強的政治後坐力， 因為防務、外事和兩岸關係雖由蔡英文統轄， 然而， 民進黨內派系政治光譜不一， 行政部門或個別民代往往在“獨派”壓力下，
另一方面， “黨產會主委”顧立雄轉任“金管會主委”， 國民黨副主席郝龍斌批評稱， 顧立雄充滿意識形態、偏頗的處事方式， 可以想像他接掌“金管會”， 將成為“金融錦衣衛”。
對此， 朱松嶺也認為， 安排顧立雄擔任“金管會主委”， 很明顯就是為了打擊國民黨的黨產問題， 因為臺灣的經濟復蘇難題無解， 所以蔡英文採取“以時間換空間”的策略， 透過鬥垮國民黨， 維持“執政”權。
而對於臺灣的發展戰略， 朱松嶺指出， 台行政機構前負責人林全的施政重點不在經濟增長， 而是社會分配， 這樣的方式是錯的， 因為一停滯就會被趕超。 他強調， “只有發展能解決發展中產生的問題”， 大陸的發展經驗就是如此，他也為臺灣多次錯過共用大陸發展機遇，感到惋惜。
綜合臺灣《旺報》、《中國時報》報導。
大陸的發展經驗就是如此，他也為臺灣多次錯過共用大陸發展機遇，感到惋惜。綜合臺灣《旺報》、《中國時報》報導。