說到玉皇大帝自然就要提到另外一個人， 這個人就是王母娘娘， 在神話傳說裡他們兩個人地位都是一樣的， 就像人間的皇帝和皇后， 天上既然有天帝自然就要有天后， 所以一般都普遍認為玉皇大帝和王母娘娘是夫妻關係。 那麼玉皇大帝和王母娘娘是什麼關係呢？
《天仙配》中有一情節是這樣的：
玉皇大帝：你休要為老七求情， 如果不是你百般嬌慣這七個閨女， 她們就是動了凡心， 也不敢有這個膽子！
王母娘娘：男大當婚， 女大當嫁。 女兒動了思凡之心， 也是人之常情。 她們並非生來就是神仙， 原本也是凡人， 愛自己所愛， 那有什麼錯嘛？
玉皇大帝：胡言亂語， 天庭之上， 豈能容忍人之常情啊！她們既已成仙， 就得遵天規守天條。
王母娘娘：如果神仙都不能有人之常情， 也不能有七情六欲， 那將來誰還願意做神仙哪？我看你總有一天， 會成為孤家寡人的！
玉皇大帝：你給我閉嘴。 朝中之事， 休得干預！
王母娘娘：老七是我的女兒， 也是後宮之事。 我身為後宮之首， 我自然應該管！這是寢宮， 又不是你的靈霄殿。 你對結髮之妻， 擺什麼帝王威風啊？
玉皇大帝：放肆！
王母娘娘：你越來越專橫跋扈了， 你只是個帝王， 你不是父親和丈夫了， 你已經沒有了親情。 張百忍哪張百忍， 你......
玉皇大帝：我說娘娘， 這......張百忍， 張百忍是誰呀？
王母娘娘：你不知道張百忍？那...那...那張友人你總該知道是誰吧？
玉皇大帝：這兩個名字， 朕怎麼聽著耳熟啊？可是一時又想不起來， 朕在哪兒見過他們。
王母娘娘：你連自己當玉皇大帝之前的名字都記不起來了， 你忘本忘到了什麼程度啊？
玉皇大帝：哦， 朕想起來了， 想起來了。 朕過去啊，
王母娘娘：哼， 你還知道人之常情啊？想當年， 你還是張家灣莊主的時候， 你通情達理， 寬厚仁愛。 咱們家兒女繞膝， 親情融融。 可靈霄寶殿的叩拜聲， 都讓你變成薄情寡義， 不識人間煙火的人了！
我們也一直認為玉皇大帝和王母娘娘是夫妻關係， 但是關於玉皇大帝和王母娘娘是什麼關係的另外一種說法， 是說他二人並非是夫妻關係， 非但不是反而是八竿子也打不著的兩位神仙， 只是在中國源遠流長的神話故事裡以及後現代的小說中才會把他們兩個人當做是夫妻。
在道教一些典籍的記載中就說到， 王母娘娘就是西王母， 乃是天地至陰之氣凝聚而成的， 從盤古開天闢地時就已經修煉成形， 是女仙之首， 其修煉與居住之地為西昆侖。 早在先秦時期西王母的名字就出現在眾多的典籍之上， 像最著名的《山海經》， 但是當時所記載的西王母的面貌乃是半人半獸一樣的怪物，
而玉皇大帝的出現則要晚上許多， 他是眾神之首， 關於他的出現和來歷民間就出現了很多的說法， 第一種說的就是他本來不過是人間的一個小寨子的寨主被太白金星帶上天庭當了玉帝;第二種說法則是要提到姜子牙封神， 玉帝的位置他給留到最後， 是想給自己的， 不想卻被一個叫張友人的叫花子搶了位置， 成了玉皇大帝;第三種說法是玉帝的前身乃是光嚴妙樂國的王子。
不管何種說法都說明玉皇大帝和王母娘娘之間並不是夫妻關係， 這些都是後人杜撰出來的。