膽囊結石是一種常見疾病， 在其非急性發作時可以沒有症狀或只有一些非特異的上消化道症狀。 對於那些有膽結石的患者不要將上腹部不適都歸結於膽結石， 以免延誤其他疾病的治療。 膽結石主要需要與以下疾病相鑒別。
1. 胃十二指腸潰瘍：該病同樣有上腹部間隙性疼痛不適， 易誤診。 潰瘍病主要表現為反酸， 噯氣， 上腹
部飽脹， 週期性節律性疼痛， 進食或服止酸劑可緩解。 胃鏡及鋇餐檢查有潰瘍病的特徵性表現。
2. 結腸肝曲腫瘤: 不適部位同樣在右上腹， 進食後由於胃結腸反射引起結腸收縮而疼痛發作， 與膽結石進食後發病相似， 要加以鑒別。 如果腫瘤引起結腸不完全梗阻， 可以引起右上腹陣發性疼痛， 屬於絞痛性質， 像膽絞痛發作。 但結腸腫瘤有大便次數增多， 大便習慣改變， 黏膿血便， 全身毒血症狀等
。
3. 膽總管結石：膽總管結石如果沒有引起膽道完全梗阻， 可以不引起黃疸和發熱等膽管炎症狀， 只表現為右上腹隱痛， 進食後明顯。 B超和MRI可幫助診斷。
4. 右腎結石：大的腎盂內結石可只表現為脹痛而非絞痛。 B超和腹部平片， 靜脈腎盂造影可幫助鑒別診斷。
5. 肝臟疾病：如肝膿瘍， 肝腫瘤同樣可表現為右上腹不適及右上腹疼痛。
6. 右胸疾病: 如右側胸膜炎， 右下肺炎。 這些疾病刺激肋間神經， 由於右上腹有肋間神經支配， 所以同樣表現為右上腹痛。
7. 膽囊癌：膽囊結石病史長， 近來發作加重， 症狀持續者尤其要注意。