崇禎給袁大人定了許多罪， 但就是沒有"通敵"、"謀叛"， 崇禎留了他幾個月， 殺他是因為民憤不平， 國法不容。 民憤主要是京畿地區的， 因為袁大人自己保證在薊西堵住後金軍， 他上奏曰：必不令敵越薊西， 結果他瞎指揮， 後金軍過了他都不知道， 第二天才往北京趕。
袁崇煥被淩遲的罪名在《崇禎長編》裡記載得很詳細：諭以袁崇煥付託不效， 專恃欺隱， 以市米則資盜， 以謀款則斬帥， 縱敵長驅， 頓兵不戰， 援兵四集， 盡行遣散， 及兵薄城下， 又潛攜喇嘛， 堅請入城， 種種罪惡。 命刑部會官磔示， 依律家屬十六以上處斬，
其中把袁大人出關以後為後金張羅的一切都包括進去了， 但就是沒有通敵、謀叛等字樣。
袁崇煥究竟對明朝做了些什麼，
天啟五年（1625）歲末， 覬覦明朝秋糧的後金即將入犯， 獲悉情報的薊遼經略高第將時任寧前道右參政的袁崇煥召至山海關面議， 做出了正確妥善的軍事部署.
根據《三朝遼事實錄》卷十六記載："經略高第奏:臣詢關外地勢之險要， 城垣之堅瑕。 去關七十裡有前屯城， 系總兵趙率教所修築， 垣墉峻正， 四面建空心台， 平放火炮， 使虜不敢近城， 可稱要地。
又一百三十裡有寧遠城， 乃袁參政、滿總兵所督修， 牆高四丈， 周圍新整， 堅固足壯金湯， 內以保障關門， 外以捍禦強虜， 此為第一扼要。 由此東如錦州城， 大而朽壞， 松山、杏山、右屯， 城小而薄， 皆前鋒游哨之地， 夏秋無事， 防護屯種， 入冬遇大敵， 則歸併寧遠， 以便保守。 自歲前聞奴欲犯右屯，
如果執行了這個軍事部署， 明朝在甯遠之戰中的損失將會最小， 後金的戰略目的將會落空。
然而， 袁崇煥回到寧遠以後卻變卦了， 他以錦右糧屯通判金啟倧的呈照作為藉口，
"甯前兵備袁崇煥揭：據管錦右糧屯通判金啟倧呈照;錦、右、大淩河三城皆前鋒要衝， 倘收兵退守， 既安之百姓複罹播遷， 已複之封疆反歸夷虜， 榆關內外更堪幾次退守耶;呈詳到道， 據此為照。
兵法有進無退， 錦、右一帶既安設兵將藏卸糧料， 部署廳官， 安有不守而撤之？萬萬無是理！脫一動移， 示敵以弱， 非但東奴， 即西虜亦輕中國。 前柳河之失， 皆緣若輩貪功， 自為送死， 乃因此而撤城堡， 動居民， 錦右搖動， 寧前震驚， 關門失障， 非本道之所任者矣！
必如閣部言， 讓之又讓， 至於無可讓而止？今只擇能守之人， 左輔守大淩河， 樊應龍等守右屯， 更令一將守錦州， 此城大於右屯， 然稍後緩矣。 三城屹立， 死守不移，
袁崇煥在揭中的口氣傲慢之極， 完全不把上司高第放在眼裡， 更不用說執行了。 然而， 後金大軍一到， 先前大言不慚的袁崇煥便龜縮在寧遠城中， 把城門從裡面填塞住， 任憑敵軍在錦、右地區燒殺搶掠， 並無一策一兵阻撓之。
這還不算完，二十六日，聞大明關軍所需糧草俱屯于覺華島，離甯遠南十六裡，遂命兀內革率八固山蒙古，又益兵八百往取之。見大明守糧參將姚撫民、胡一甯、金冠、遊擊李善、張國青、吳遊擊于冰上安營，鑿冰十五裡，以戰車為衛。我兵尋未鑿處殺入，遂敗其兵，盡殺之。又見二營兵立於島山之上，遂沖入，亦盡殺之。焚其船二千餘及糧草千餘堆，複回大營;.
覺華島的慘重損失袁崇煥也脫不了干係，寧前道的管轄地區東至塔山，西抵山海關，而覺華島位於寧遠以南十六裡的海中，岸邊還有距離寧遠僅五裡的儲糧要地龍官寺。袁崇煥為什麼不把糧草運入城防堅固的寧遠城，而是勞師費力地運到冬季會結冰的覺華島？早就通曉關外情形的他為什麼要這樣做呢？
袁大人出關以前，後金由於饑荒而沒有糧食吃，窘迫得向朝鮮要糧食，懇求王之臣和毛文龍談判都遭拒絕，攻不破關寧防線，又因為有毛帥的牽制而不能繞道蒙古，非常困難。
可袁大人出關後，不僅殺毛帥毀東江，私下議和又賣糧食，讓後金安然繞道蒙古，使關寧防線報廢了，從此關內再無寧日了。
毛文龍
另外，崇禎殫精竭慮湊來的遼餉和最後的主力都損失掉了，其實中興之策已經失去了最後的依託。
袁大人消耗的甯錦防線上的太多的資源，不僅導致了薊鎮無法加強而被後金突破，還導致了其他幾個北方軍鎮的軍餉、糧餉無法如數派發，災民不能得到及時的賑濟，這導致了諸如李自成這樣流民和潰兵相結合的起義，最終導致了北京在遭受瘟疫以後被流寇輕易攻陷。
就明朝滅亡而言，袁大人這幾下子確實來得不輕，而且很不是時候，小冰河期自1580年起，持續70餘年，明朝以那點可憐的財政，一直撐到了1644年。
所謂康乾盛世，其實只不過是災害逐漸減退帶來的恢復而已，離明朝正常水準還差了很遠，若沒有袁大人這幾下子折騰，明朝再熬上幾年，就緩過氣來了，國力恢復到相當水準，那不是後金這種對手能應付的。
這還不算完，二十六日，聞大明關軍所需糧草俱屯于覺華島，離甯遠南十六裡，遂命兀內革率八固山蒙古，又益兵八百往取之。見大明守糧參將姚撫民、胡一甯、金冠、遊擊李善、張國青、吳遊擊于冰上安營，鑿冰十五裡，以戰車為衛。我兵尋未鑿處殺入，遂敗其兵，盡殺之。又見二營兵立於島山之上，遂沖入，亦盡殺之。焚其船二千餘及糧草千餘堆，複回大營;.
覺華島的慘重損失袁崇煥也脫不了干係，寧前道的管轄地區東至塔山，西抵山海關，而覺華島位於寧遠以南十六裡的海中，岸邊還有距離寧遠僅五裡的儲糧要地龍官寺。袁崇煥為什麼不把糧草運入城防堅固的寧遠城，而是勞師費力地運到冬季會結冰的覺華島？早就通曉關外情形的他為什麼要這樣做呢？
袁大人出關以前，後金由於饑荒而沒有糧食吃，窘迫得向朝鮮要糧食，懇求王之臣和毛文龍談判都遭拒絕，攻不破關寧防線，又因為有毛帥的牽制而不能繞道蒙古，非常困難。
可袁大人出關後，不僅殺毛帥毀東江，私下議和又賣糧食，讓後金安然繞道蒙古，使關寧防線報廢了，從此關內再無寧日了。
毛文龍
另外，崇禎殫精竭慮湊來的遼餉和最後的主力都損失掉了，其實中興之策已經失去了最後的依託。
袁大人消耗的甯錦防線上的太多的資源，不僅導致了薊鎮無法加強而被後金突破，還導致了其他幾個北方軍鎮的軍餉、糧餉無法如數派發，災民不能得到及時的賑濟，這導致了諸如李自成這樣流民和潰兵相結合的起義，最終導致了北京在遭受瘟疫以後被流寇輕易攻陷。
就明朝滅亡而言，袁大人這幾下子確實來得不輕，而且很不是時候，小冰河期自1580年起，持續70餘年，明朝以那點可憐的財政，一直撐到了1644年。
所謂康乾盛世，其實只不過是災害逐漸減退帶來的恢復而已，離明朝正常水準還差了很遠，若沒有袁大人這幾下子折騰，明朝再熬上幾年，就緩過氣來了，國力恢復到相當水準，那不是後金這種對手能應付的。