副醫囑就是針對不同的患者進行醫囑之外的必要提醒，讓患者對疾病的治療有一個積極的配合作用，減少不必要的醫療過失，盡可能地使其達到最佳的治療效果，這樣的醫囑，我們稱之為副醫囑。常見的副醫囑有：心理提示、服藥反應、忌口等。
中醫治病是一個系統工程，哪個環節出了問題都會直接影響療效，有的甚至會出現副反應。再好的醫生和處方，如果患者煎藥、服藥落實不到位，也很難達到預期的效果，尤其是中藥煎劑講究更多。中藥煎劑是將醫生開好的中藥飲片進行煎煮，有條件的醫院或藥房指定專人用煎藥機按照相關規定煎藥，患者取藥後只需按醫囑忌口即可。但是，大部分病人需要回家煎藥，煎藥過程包括煎藥容器選擇、藥物浸泡時間、煎煮次數、每次煎藥的時間、每次煎藥時添多少水、特殊藥的煎煮等，這些內容患者僅憑醫生口頭簡單告知是很難記住的。這樣下去，患者及其家屬煎不好藥，藥效就很難得到保障，個別患者還會出現身體不適等副作用。譬如說，制附子，如果不先煎1~2小時，病人飲後會出現舌頭麻木的感覺；再者，服藥也有很多講究，有的湯藥需要藥引子，如張仲景的麻黃湯飲用時需要再喝熱米粥以助病人發汗。為了解決這些問題，醫生在開好方後應該有個副醫囑。
醫生通過對患者的病情進行綜合分析之後作出正確診斷，然後根據該診斷擬定的治療方法，我們稱之為主醫囑。目前，副醫囑在醫院沒有得到很好重視，給患者帶來諸多不便。
總之，要落實好副醫囑，發揮中醫藥的最大療病作用，醫生不妨考慮細緻一點，將療病方面所涉及的一切都列印在一張紙上，讓患者人手一份，內容包括煎藥方法、服藥方法及其注意事項等，並針對不同的患者給予特殊標注，讓患者一看便知，這才是真正的為患者服務。