中晚期食道癌90%以上都有咽下困難。它的特點是起初時為偶然出現，程度也輕，以後逐漸加劇。初起時患者僅在大口吞咽幹硬食物時才感梗噎，需用水沖服或嘔吐後才感舒服。以後發展到吃普通飲食也需細嚼慢嚥，或用湯水送下。隨著病情加劇，吃麵條、稀飯也發生困難，最後甚至連流汁、茶水都無法咽下。
咽下疼痛是食道癌中晚期的另一較常見症狀。痛的性質為隱痛、灼痛、刺痛。由於病變部位不一，疼痛可分別出現在頸、胸及上腹部。在進幹食時痛更明顯。引起疼痛的原因為癌腫附近的食道周圍炎症，癌腫向縱膈旁引起縱隔炎，或癌直接侵犯脊柱。後兩種痛較持久而頑固。
由於癌腫引起食道的部分阻塞或完全阻塞，病人可出現嘔吐，甚至沒吃什麼食物也會吐出有大量泡沫的粘液樣痰。
當食道癌發展到晚期，除了癌腫消耗大量營養物質外，又因嚴重的咽下梗阻使進食及飲水量有明顯減少，造成消瘦、貧血、皮膚鬆弛、乾燥、全身虛弱無力等表現。一旦有遠處轉移，常在頸根部出現腫大質硬的淋巴結。當食道內有較多食物、粘液殘瘤時，又可因食道逆行蠕動而被吸入到氣管或肺內引起吸入性肺炎。