牙周炎的病因是牙菌斑的堆積，而口腔中的牙菌斑是在不斷形成的，即便每天認真的刷牙，仍免不了有些部位存有牙菌斑，因此牙周炎很容易復發。因此，牙周炎的治療不是一勞永逸的，需要長期保持口腔衛生，定期複查，進行必要的補充治療，才能鞏固療效。
每天及時清除口腔中的菌斑，保持相對清潔的牙面是預防牙周炎復發的關鍵。同時應該定期複查。有研究表明，對大多數人來說，每個半年或一年接受一次牙周檢查和治療，是預防牙周炎的有效措施。複查的內容和間隔因人而異，一般來說病情越重，複查的間隔越短，例如糖尿病患者，妊娠期，或同時進行正畸治療的患者都需要經常複診。
治療牙周炎的時間主要分為以下四個時間段：
1、牙周基礎治療要消除各種可能的致零因素，消除和控制牙周組織的炎症。包括傳授和指導患者進行自我菌斑控制，儘量規勸患者戒煙，常規的齦上潔治、齦下刮治根面平整，必要的牙體牙髓的治療，必要的咬合調整，拔除無保留價值的患牙，必要的藥物治療等，通常要1～2個月才能完成。
2、牙周手術治療是牙周治療的第二階段。一般是在基礎治療後I-3個月時，對於牙周狀況進行再次的全面評估，包括牙菌譬控制情況，牙周袋深度，探診出血情況，牙槽骨形態等。如果些苧石然有大於5毫米的牙周袋，並且有探診出血，或者牙齦和乏孽蕃的形態異常，需要進行修整時，可以根據具體的情況和部位誓擇牙周手術的類型。切忌沒有經過牙周基礎治療，沒有很好地控制炎症就進行牙周手術治療。
3、牙周修復治療階段是牙周治療的第三階段。通常在牙周手術後2～3個月時進行。因為此時牙周組織的形態和位置已基本穩定，可以進行永久性的修復治療和鬆動牙的固定。需要進行正畸治療的患者也可以在這個時期進行。
4、牙周支持治療是牙周治療的第四階段，以往稱之為維護期，同樣是很重要的階段。在此階段要定期複查，檢查患者菌斑控制情況、牙齦炎症情況、牙周袋深度、牙槽骨的變化以及危險因素的控制情況等。發現問題，進行必要的再次治療。醫生會根據每一位元患者的具體情況確定該患者的複查的間隔時間。通常要3～6個月複查1次，1年左右拍1次X線片。