生理性飛蚊症無需治療。病理性玻璃體混濁要針對原發病進行治療。新鮮的玻璃體積血應臥床休息，應用止血藥物。陳舊性出血者，應用促進混濁吸收的藥物。
中醫治療：1對退變性玻璃體混濁，以補養肝腎，益精明目為主。
2對出血性玻璃體混濁，早期新鮮出血者應以止血為主，活血祛瘀，軟堅散結，促進出血的吸收。
手術治療：若玻璃體積血經合理藥物治療，超過3個月，仍未吸收者，玻璃體混濁患者應當考慮做玻璃體切割術。但對於病情不穩定容易再出血者，如糖尿病性視網膜病變，應先用中醫治療法，控制糖尿病，然後再適當考慮手術，但是副作用比較大容易復發。
治療玻璃體混濁，醫生一般會採用上述介紹的3種常見方法。到底要選擇哪種方法，就要根據患者的具體情況來作出判斷。病情較輕的患者，一般會採取藥物治療與中醫治療，病情較為嚴重的，一般就要先通過藥物治療，再對其進行手術治療。