在醫生給小香解釋了什麼是乙型肝炎病毒後，小香的好奇心就更強烈了，非要把這個討厭的疾病給弄清楚不可，但醫院的醫生非常忙碌，沒時間回答他那麼多的問題。於是小香回家後不斷地查閱相關資料，試圖找到乙型肝炎的發病原因。家人看他都快魔症了，又怕他太辛苦，不利於治療，只好托人找來一個學醫的朋友，為小香詳細講解乙型肝炎的發病原因。
一般來說，乙型肝炎病毒入侵肝細胞後，HBV不直接損害肝細胞，或者說乙型肝炎不是HBV直接損害所引起的，而是HBV感染後激發起的人體免疫應答。所謂免疫應答是指抗原侵入人體後首先由巨噬細胞撮取和處理後，將抗原資訊傳遞給T淋巴細胞和B淋巴細胞，這兩種淋巴細胞進行增殖和分化，T淋巴細胞分化成淋巴母細胞，最終成為致敏的T淋巴細胞，其中細胞毒性T淋巴細胞識別被HBV感染了的肝細胞後即產生穿孔素和顆粒酶損害了肝細胞膜，Na+、Ca2+和水流入肝細胞內，K+從肝細胞內流出，引起肝細胞溶解破壞;此外CD，Th釋放多種淋巴因數引起肝細胞炎症反應，此種變化稱為“細胞免疫”，這就是乙型肝炎發病的機制。B淋巴細胞分泌抗體在血中，稱為“體液免疫”，抗體不能進入肝細胞內，既不能破壞肝細胞，也不能殺滅肝細胞內的HBV，故乙型肝炎的發病主要是細胞免疫所致。但肝細胞破壞溶解後.HBV從肝細胞內釋放出，可被巨噬細胞吞噬，或與乙型肝炎表面抗體結合，成為免疫複合物後被巨噬細胞吞噬井由腎排出，使HBV得以清除，以防止肝細胞破壞後釋放出的HBV再次侵入未受感染的肝細胞。
近來有人發現免疫應答過程中產生的細胞因數，如r一干擾素等可不通過肝細胞的溶解，在肝細胞內清除HBV。