乙型肝炎抗原、抗體檢測目前主要用血清學方法檢測HBsAg、抗-HBs、HBeAg、抗-Hbe及抗-HBc（俗稱“兩對半”），抗-PreS1或抗-PreS2的檢測不常用。HBcAg僅存在於肝細胞內，也不用於常規檢查。HBsAg的檢測最為重要，可發現無症狀攜帶者，是獻血員篩選的必檢指標。近年來，PCR已用於乙肝臨床診斷。血清學方法以RIA和ELISA最為敏感，而PCR中以PCR-ELISA和PCR螢光法最常用。
乙型肝炎抗原、抗體檢測結果的分析HBV抗原、抗體的血清學標誌與臨床關係較為複雜，必須對幾項指標同時分析，方能有助於臨床判斷。
HBsAg陽性見於急性肝炎、慢性肝炎或無症狀攜帶者。急性肝炎恢復後，一般在1～4個月內HBsAg消失，若持續6個月以上則認為已向慢性肝炎轉化。無症狀HBsAg攜帶者是指肝功能正常者，攜帶者的肝穿刺病理組織切片常可發現已有病變，但無臨床症狀。攜帶者可長期為HBsAg陽性，也可伴有HBeAg陽性及病毒血症，具有很強的傳染性，少部分可發展為肝硬化或肝癌。
抗-HBs的出現常顯示患者已恢復或痊癒，抗-HBs效價高者預後更好。HBeAg陽性提示HBV在體內複製，如轉為陰性，表示病毒停止複製。抗-Hbe陽性表示機體已獲得一定的免疫力，出現變異株者例外。抗-HBcIgM陽性，則提示仍有病毒複製。