拉米夫定發生耐藥變異後1-4個月內雖都有病毒再現，但根據乙肝患者病情的不同，可能出現無症狀變異病毒攜帶、慢性無症狀病毒攜帶或肝炎復發、病變急性加重、免疫抑制患者發生嚴重肝損害等多種情況。
1、無症狀變異病毒攜帶：約半數患者發生拉米夫定耐藥後雖然可產生變異毒株，但生活力較低，因此並無其他症狀出現，血清轉氨酶持續正常。
2、慢性無症狀病毒攜帶或肝炎復發：應用拉米夫定耐藥的患者在停藥3-4個月後，變異毒株複製活性低，可被複製活性較高的野生毒株取代，表現為慢性無症狀病毒攜帶或肝炎復發。
3、病變急性加重：發生耐藥變異後未及時停藥，仍然繼續應用拉米夫定治療的患者ALT增高，多在半年後病變急性加重，尤其病毒水準顯著較高的患者病毒達峰值後逐漸病變加重，甚至肝功能失代償。
4、免疫抑制患者發生嚴重肝損害：免疫抑制患者應用拉米夫定耐藥後，可能發生纖維化淤膽性肝炎，甚至合併肝衰竭而導致死亡，進行肝移植、腎移植手術的患者如對拉米夫定耐藥，也可能產生嚴重肝損害。