系統性紅斑狼瘡是一種累及多系統多器官的自身免疫性疾病，主要累及皮膚黏膜、中樞神經系統、腎臟及骨骼肌肉，同時也可累及心臟、肺、血管等多個系統和器官，其併發症對人體危害極大。
1.腎臟病變：最常見的併發症，稱為狼瘡性腎炎。多數病人可出現蛋白尿、紅白細胞尿及管型尿或呈腎病綜合征表現，伴有浮腫、高血壓、腎功能減退、夜尿增多，狼瘡性腎炎常在發熱，關節炎等腎外表現後出現。此類併發症如不及時治療，很容易危及病人生命安全。
2.肺部病變：稱為狼瘡性肺炎。病人出現呼吸系統症狀，表現為咳嗽不停，呼吸不通暢，嚴重時可出現上氣不接下氣的表現。此類併發症嚴重影響病人的生活。
3.消化系統病變：病人常出現嘔吐不止，食欲減退等消化系統病變症狀。影響病人身體及疾病的康復。
4.心臟病變：常出現心包炎，心肌炎及心臟瓣膜病變等心臟病變，病人出現心律不齊，活動受限等不適反應。如不及時有效治療，嚴重時可導致病人出現心衰而死亡。
5.血管病變：大多數病人會出現血管硬化的現象，出現高血壓，高血脂等症狀。不及時治療會引起嚴重的冠狀動脈硬化，危及生命。
6.皮膚病變：表現為皮膚紅斑及皮膚黏膜的損害，常出現口腔潰瘍。影響病人的生活及疾病的康復。