慢性腸炎是一種常見的，由病毒，細菌或者是寄生蟲等引起的常見性腸胃疾病。除了病菌的感染之外，大部分原因是由飲食上的不注意引起的。比如：不乾淨或是刺激性較強的食物。慢性腸炎嚴重時可能帶來出血，穿孔等併發症。所以治療慢性腸炎，刻不容緩。
慢性腸炎的治療也應對症下藥，針對不同病原的慢性腸炎有不同的治療方法。一般程式，當患者進入醫院進行治療時，首先要根據其病史以及病症的臨床表現來做一個初步的判斷。然後在依據檢查結果來確診。
在治療慢性腸炎時，如果是病菌感染性的慢性腸炎，可以採取的是病原治療的方法。根據不同的病菌採用不同的抗菌藥。當然，對於有的病菌來說，很輕微時，可不用抗菌藥也能自愈。另外，病毒性的慢性腸炎也不需要，一般可自愈。
慢性腸炎一般都伴隨著腹瀉，所以補充體液也是治療慢性腸炎應該注意的。在治療慢性腸炎時，可口服或靜脈注射葡萄糖等。為了減少腹瀉，也可服用一些減少腸道蠕動以及分泌物的藥物，以達到止痛和止瀉的作用。
病從口入，慢性腸炎更是如此。為了預防以及康復，在日常生活中要有良好的用餐習慣，不吃變質不乾淨的食物，養成飯前便後洗手的習慣。不可暴飲暴食，對於食品的衛生也要特別注意。