直腸炎與眾腸炎不同的是其種類較多，而且直腸炎的病因也複雜。那麼直腸炎診斷方法是什麼呢?慢性直腸炎鏡檢的特點是：粘膜腫脹、肥厚，表面呈粗糙顆粒，有少量粘液，萎縮性直腸炎鏡下可見：粘膜乾燥、色灰白，粘膜下可見血管網。
臨床上根據其病因、症狀分為：急性卡他性直腸炎、慢性潰瘍性直腸炎、放射性直腸炎、慢性肥大性直腸炎和慢性萎縮性直腸炎。這5種直腸炎，除前一種是急性的以外，其餘4種均為慢性。
1.帶有膿血便、黏液便的有急性卡他性和潰瘍性直腸炎
2.其中糞便帶有黏液和血絲的有肥大性和萎縮性直腸炎
3.有時腹瀉、有時便秘的是肥大性和萎縮性直腸炎
4.有直腸出血症狀的是放射性直腸炎
5.有裡急後重的是卡他性和潰瘍性直腸炎。
其他是共有的症狀。根據以上特點，可以判斷是屬於哪一種腸炎。
慢性直腸炎指診可觸到直腸粘膜彈性減弱，粗糙呈顆粒狀突起或有疤痕。直腸鏡檢查可見粘膜水腫、肥厚，色黃白，被覆粘液，擦去粘液，可見粘膜表面不光滑，個別部位有糜爛。細菌培養和活體組織檢查，可確定病因診斷。慢性直腸炎鏡檢的特點是：粘膜腫脹、肥厚，表面呈粗糙顆粒，有少量粘液，萎縮性直腸炎鏡下可見：粘膜乾燥、色灰白，粘膜下可見血管網。
急性直腸炎肛門腫脹發熱，肛門部皮膚潮濕發紅，指診觸之直腸有劇烈疼痛，括約肌痙攣肛門口緊張。直腸鏡檢查可見粘膜充血、水腫、出血、糜爛，表面有黃色膿苔或點狀潰瘍，大便培養或活體組織檢查找出致病菌，能確定病因診斷。急性直腸炎鏡檢的特點是：直腸粘膜深紅色、腫脹，呈縱形皺折，皺折間有分泌物。
潰瘍性直腸炎的診斷：如果病情變輕，可只有間歇性的直腸小量出血，常被誤認為是痔瘡出血。還有些患者表現為便秘，大多是因為有了炎症的直腸痙攣所致。也有些患者雖患有潰瘍性直腸炎，但其並沒有便血的症狀，而只是排便次數增多且為不成形的軟便，且多發生在早上，要排2到3次不成型軟便，而在一天的其餘時間則與正常人一樣。