腦梗塞患者病理生理及生化改變呈一個動態發展過程，在臨床中主要可分為急性期、恢復期、後遺症期等多個階段，急性一般持續一個月，恢復期根據病情嚴重程度可達2~6個月，6個月後患者即進入後遺症期。
對於不同時期的治療，應遵循以下原則：
1、急性期--腦梗塞患者突然發作6小時內積極治療有望逆轉病程，可在腦保護治療下採取緊急溶栓複流，如已超過6小時，應進行對症治療並積極防治腦水腫，預防併發症產生。需要注意的是，腔隙性腦梗塞患者治療應以改善迴圈為主，不宜脫水治療。
2、恢復期--一般腦梗塞患者腦水腫、顱內高壓症狀消退後即進入恢復期，應繼續及酌情調整改善腦血循環和腦保護劑的措施，仍有高血壓者應繼續給予降壓藥物，有條件者可選用改善腦迴圈、神經保護劑和中藥等藥物治療。
3、後遺症期--腦梗塞患者後遺症期患者病情穩定，多數症狀得到很大改善，但認知、言語及肢體運動等症狀尚未完全恢復，可通過針灸、功能鍛煉、康復治療等逐步改善。