胸腺瘤患者胸腺摘除術後出現重症肌無力的原因：
手術作為誘因，使原潛在的重症肌無力表現出來。
原有重症肌無力不明顯而漏診。
因發現胸腺瘤而進行胸腺摘除。但由於胸腺摘除不徹底，或有異位胸腺，體內繼續產生乙醯膽鹼受體抗體，等病情重到一定程度再就診時才作出重症肌無力診斷，故給人一種錯誤的印象，好像是胸腺摘除術後才發生重症肌無力，其實不然。
去除抑制
有些胸腺瘤可能由抑制性T細胞組成，於胸腺摘除術後確無重症肌無力。但手術去除了抑制因素，使原處於抑制狀態的異常免疫表現出來，臨床上出現重症肌無力。
其他因素
當然，也應考慮胸腺外因素在重症肌無力發病機理中起作用的可能。