面部肌肉萎縮是很影響個人形象的疾病，對於面部肌肉萎縮的產生原因，主要可以分為神經源性肌肉萎縮、肌源性肌肉萎縮、廢用性肌肉萎縮，這三種都是面部肌肉萎縮的主要產生原因。
三者又彼此互相關連，而上運動神經元性病變雖也出現面部肌肉萎縮，有人將其列為繼發性，晚期為廢用性萎縮。肌原性肌肉萎縮是指肌肉本身病變引起的。廢用性肌肉萎縮是由於全身消耗性疾病。
神經原性面部肌肉萎縮常見的原因為廢用、營養障礙、缺血和中毒。前角病變、神經根、神經叢、周圍神經的病變等均可引起神經興奮衝動的傳導障礙，從而使部分肌纖維廢用，產生廢用性肌萎縮。
另一方面當下運動神經元任何部位損害後，其末梢部位釋放的乙醯膽鹼減少，交感神經營養作用減弱而致面部肌肉萎縮。
面部肌肉萎縮的原因瞭解可以有效地幫助預防和治療面部肌肉萎縮，當然也可能由其他原因導致面部肌肉萎縮，比如肩帶或面肩肱型的肌營養不良患者，通過形態學檢查證實為脊髓型肌萎縮。