甲亢突眼一般有兩類，一類是浸潤性突眼，又稱惡性突眼，這類突眼雖多與甲亢併發，但並非甲亢所致，即使甲亢治癒，突眼也不一定好轉，大多保持不變，少數可緩解，但亦有少數患者可加重，目前尚缺少明顯有效的藥物和治療方法。另一類並非真正的突眼，只是甲亢引起提上眼瞼肌病變，造成的突眼假像，此類占突眼的大多數，多數隨甲亢好轉而緩解，稱為良性非浸潤性突眼。惡性突眼的發病是細胞免疫和體液免疫聯合作用的結果。
甲狀腺大部分切除術對於良性突眼是首選治療方法。手術不但治癒了甲亢，而且對良性突眼的眼征有不同程度的減輕。而惡性突眼患者行甲狀腺大部分切除術後，會使突眼加重，多於術後1個月開始出現，可能與甲狀腺受損，抗原釋放增多有關，如果發生甲減也可加重突眼。
因此甲亢術前明確診斷良性和惡性突眼非常重要。對於惡性突眼患者手術應慎重，伴有高代謝綜合征者，用小劑量抗甲狀腺藥物緩慢地控制甲亢，輔以其他方法治療突眼是比較安全可取的措施，但是有時也可導致突眼惡化，故治療過程中必須隨時觀察，防止其發展。