使用西藥治療甲亢時，要注意年齡、性別、病情選擇藥物，治療中應注意觀察病情的變化，有無對甲狀腺藥物過敏，有無藥疹，肝損害，白細胞減少，應定期複查肝功能和血常規。使用中藥治療時要注意煎藥、服藥的方法，服藥過程中的禁忌。
患者服用抗甲狀腺藥物治療時，家屬應按時督促患者按時服藥，並講明堅持服藥的重要性，克服厭煩心理，使患者生動配合。
根據患者病情的輕重程度決定用藥劑量和療程。治療量要充足，減藥要緩慢，維持量時間要長，一般需1.5～2 年，停藥要慎重。治療期間如有突眼加重、甲狀腺增大或有甲狀腺功能減退症狀時，應加服甲狀腺片，每天40～60毫克，老年患者應慎用。
抗甲狀腺藥物治療的主要副作用是粒細胞減少和藥疹，因此在服藥期間應注意觀察。如白細胞減少、皮疹、發熱、咽痛、關節酸痛或肝功能損害等，一旦發現，馬上與醫生聯繫，及時處理。
觀察患者服藥後有無怕冷、乏力、水腫、嗜睡、體重增加過快等表現，如發現上述症狀，可能為甲狀腺機能減退，應及時報告醫生，提供減少藥量的依據，以便及時調整劑量。
服藥1.5～2年後，若甲狀腺縮小，血管雜音消失，臨床自覺症狀好轉，心率接近正常，體重恢復至理想標準，甲狀腺功能檢查接近正常，可考慮停藥。