中醫將慢性再生障礙性貧血分為腎陰虛型、腎陽虛型及腎陰陽兩虛三大類型，針對不同類型的不同症狀予以對症治療。
腎陰虛型
主證：低熱，盜汗，眩暈耳嗚，手足心熱，口渴咽幹思飲，失眠多夢，出血明顯，常有感染，舌紅，苔淨，脈細數。
治法：滋陰補腎。
方藥：左歸飲，當歸首烏湯，大菟絲孑湯，六味地黃丸，歸芎地黃湯等。常用藥有枸杞子、菟絲子、女貞子、首烏、熱地、旱蓮草、桑椹子、山萸肉、肉蓯蓉、阿膠、黃精等。
腎陽虛型
主證：面色蒼白，頭暈無力，形摹肢冷，腰膝軟弱，夜尿多，便溏，出血輕，惑染少，舌展淡，舌體胖，邊有齒痕，脈遲細或滑。
治法：溫陽補腎。
方藥：右歸湯，十四味建中湯，金匱腎氣丸，參附湯，河車大造丸等。常用藥有仙茅、仙靈脾、葫蘆巴、肉蓯蓉、補骨脂、菟絲子、生熟地、構杞子、鹿角膠、巴戟天、紫河車、黃芪等。
腎陰陽兩虛型
主證：面白無華，畏冷，心悸氣短，盜汗自汗，手足心熱，渴不思飲，失眠遺精，便溏，少量出血，舌質淡，苔少，豁脈細數或虛大而數。
治法：陰陽兩補。
方藥：右歸飲加減，也可從上述兩型中藥中搭配選擇使用。常用藥有仙茅、仙靈脾、補骨脂、肉蓯蓉、巴戟天、熱地、首烏、女貞子、枸杞子、山萸肉、桑椹等。
但在應用中藥治療慢性再生障礙性貧血的過程中需要注意：
①陰陽互補，氣血兼顧；
②補陽藥，夏季炎熱不宜多用，冬季天寒可以多用；
③易感染者可先治標後治本，也可標本兼治，一清一補，交替服用，但應慎用苦寒藥，免傷脾胃；
④在血紅蛋白恢復正常後，要堅持治療一段時間，不可過早停藥。