侵華日軍大力研究和製造細菌武器的目的很明確， 就是要在戰場上戰勝我軍， 並在民眾中造成心理恐慌。 侵華日軍開始在正面戰場廣泛使用細菌武器是在抗日戰爭進入相持階段後。 特別是太平洋戰爭爆發後， 海上戰事吃緊， 日軍統率部決定減少在中國戰場的兵力， 把戰略重點轉向南方， 並決定在浙江、江西、湖南等地實施細菌戰。
細菌戰的參戰部隊主要由７３１部隊與１６４４部隊聯合組成， 對外使用奈良部隊番號， 直屬支那派遣軍總司令部， 由石井四郎負責指揮；具體攻擊方法為飛機散播菌液和空投感染鼠疫的跳蚤；７３１部隊參戰人員和疫菌、器材、車輛等運至前線基地——杭州，
１９４０年９月， 寧波被列為首批攻擊目標之一， 為了觀察細菌武器攻擊的結果， 日軍加強了對寧波的空中偵察。 １０月２７日晨約７時， 天色陰霾， 空襲警報突然嘶鳴， 一架日機竄入寧波市區上空， 散下大量傳單後西逃， 傳單上寫：“重慶正在鬧饑荒， 民不聊生， 日本人民則豐衣足食，
日機投放細菌武器
日機過後， 當地跳蚤驟增， 呈紅色。 後經證實， 它們均是吸飽了鼠疫試驗者血液的疫蚤。
３１日晚， 開明街口滋泉豆漿店店主賴福生夫婦最早疫死， 接著附近許多人暴死。 鼠疫在當地農村流行期達３４天， 居民死亡慘重。 據查證， 這場人為鼠疫中有名有姓的死亡人數就達１０９人。 有一位曾擔任前上海《密勒氏評論報》的美國記者約翰·威廉·鮑威爾， 他曾經目睹了這次日軍在寧波的細菌戰。 他說：“我碰巧這時在寧彼。 日本軍隊在當地進行細菌戰， 使得許多中國農民像不起眼的小蟲子一樣被殺掉。 ”戰後才知道， 日軍在寧波的細菌戰， 是日本醫學博士、細菌專家、７３１部隊長石井四郎親自指揮進行的。
１９４０年１０月４日， 日軍對衢縣東峪口一天即死去１０餘人， 一月死掉五六十人， 孟口同樣亦死掉五六十人， 毒菌使人們成群的死亡。
1939年， 石井四郎（左）因諾門罕戰爭的“成績”被授予勳章；石井四郎的兄長石井剛男（右）也被授勳
１９４１年１２月２８日， 《晉察冀日報》報導：
“最近敵寇‘掃蕩’定縣時，
１９４２年３月７日， 《晉察冀日報》刊載冀中軍區司令部、政治部《告全世界人士書》稱：“敵寇於１９４２年２月１４日配合軍事‘掃蕩’沿平漢路定縣一帶散發經過注射鼠疫細菌的病鼠， 企圖造成鼠疫流行的大慘禍。 ”
１９４２年６月１６日《晉察冀日報》刊載亦容同志《粉碎鬼子的“毒菌戰”》一文揭露：敵人“散放病菌多是在‘掃蕩’當中， 派出漢奸間諜帶著製成病菌的毒藥， 丟到咱們吃水的井裡；赤痢菌多是放到人家住的房子裡；鼠疫或是鼠傷寒的病菌， 是把注射過這種病菌的老鼠，丟到村子裡”。
這些報導是真實可靠的，因為在河北省的一些村莊的確在日軍“掃蕩“過後，曾突然爆發大規模瘟疫，致使很多人染病身亡。日本細菌部隊在華北抗日根據地進行細菌戰的真實情況，在戰後，有一位曾在哈爾濱平房鎮原７３１細菌部隊工作過的隊員向日本記者說，使用細菌炸彈的爆炸實驗，曾在“北京和華北地區的戰鬥中進行實地試驗”。
至於日本細菌武器研究的最大基地東北地區，包括哈爾濱的平房地區和吉林農安、孟家屯等地，鼠疫、傷寒等疫病災禍更是連年不斷，甚至抗戰勝利以後，還有鼠疫蔓延。１９４０年夏，吉林省農安縣突然蔓延起奇怪的鼠疫，鼠疫本來主要在冬季流行，但這次夏季就流行起來，從縣城蔓延到農村，似有燎原之勢。死亡人數達３００多人。日本戰敗投降以後，哈爾濱的平房附近，也發生了“全境鼠疫大流行”。平房附近二道溝的靖福和在控訴７３１細菌部隊罪行時說：“我們後二道溝住著５０戶人家，感染上鼠疫死了的，就有３９家。我家有１９口人，不到２０天，就死了１２人。我們村最早死的人是張顏廷，在中國，誰家裡出了不幸的事大家都去幫忙。我二十四五歲的叔叔去張家幫忙辦喪事。叔叔身體非常健壯，但辦完喪事回來以後，身體就不舒服，兩天以後，大腿根就長出了疙瘩，疼得走不了路，又過兩天就死了。後來，祖父、叔祖、姐姐、父親、弟弟、嬸嬸、小叔，全部死了。一天裡頭，有時就死兩個親人，真是太慘了！”
鼠疫所到之處，生靈塗炭
日軍屠殺中國人就像踩死螞蟻一樣，在其戰敗投降後，還把殺人的細菌撒在中國土地上。７３１部隊留給老百姓的是鼠疫，１００部隊留下的是霍亂。從１９４６年開始，連續７年，吉林省的榆樹、水吉等縣，都發生了爆發性的流行霍亂。１９４７年，齊齊哈爾、肇東、肇源、洮安、大賚、安廣、鎮賚、泰來、開通、瞻榆、洮南等地，霍亂患者達９０００余人，死亡７５００眾人。１９４５年至１９４６年，洮南、洮安、開通等縣鼠疫患者達４３００余人，死亡１４００餘人。
是把注射過這種病菌的老鼠，丟到村子裡”。這些報導是真實可靠的，因為在河北省的一些村莊的確在日軍“掃蕩“過後，曾突然爆發大規模瘟疫，致使很多人染病身亡。日本細菌部隊在華北抗日根據地進行細菌戰的真實情況，在戰後，有一位曾在哈爾濱平房鎮原７３１細菌部隊工作過的隊員向日本記者說，使用細菌炸彈的爆炸實驗，曾在“北京和華北地區的戰鬥中進行實地試驗”。
至於日本細菌武器研究的最大基地東北地區，包括哈爾濱的平房地區和吉林農安、孟家屯等地，鼠疫、傷寒等疫病災禍更是連年不斷，甚至抗戰勝利以後，還有鼠疫蔓延。１９４０年夏，吉林省農安縣突然蔓延起奇怪的鼠疫，鼠疫本來主要在冬季流行，但這次夏季就流行起來，從縣城蔓延到農村，似有燎原之勢。死亡人數達３００多人。日本戰敗投降以後，哈爾濱的平房附近，也發生了“全境鼠疫大流行”。平房附近二道溝的靖福和在控訴７３１細菌部隊罪行時說：“我們後二道溝住著５０戶人家，感染上鼠疫死了的，就有３９家。我家有１９口人，不到２０天，就死了１２人。我們村最早死的人是張顏廷，在中國，誰家裡出了不幸的事大家都去幫忙。我二十四五歲的叔叔去張家幫忙辦喪事。叔叔身體非常健壯，但辦完喪事回來以後，身體就不舒服，兩天以後，大腿根就長出了疙瘩，疼得走不了路，又過兩天就死了。後來，祖父、叔祖、姐姐、父親、弟弟、嬸嬸、小叔，全部死了。一天裡頭，有時就死兩個親人，真是太慘了！”
鼠疫所到之處，生靈塗炭
日軍屠殺中國人就像踩死螞蟻一樣，在其戰敗投降後，還把殺人的細菌撒在中國土地上。７３１部隊留給老百姓的是鼠疫，１００部隊留下的是霍亂。從１９４６年開始，連續７年，吉林省的榆樹、水吉等縣，都發生了爆發性的流行霍亂。１９４７年，齊齊哈爾、肇東、肇源、洮安、大賚、安廣、鎮賚、泰來、開通、瞻榆、洮南等地，霍亂患者達９０００余人，死亡７５００眾人。１９４５年至１９４６年，洮南、洮安、開通等縣鼠疫患者達４３００余人，死亡１４００餘人。