甄嬛傳裡， 皇上登基以後一直在處理朝政， 後宮呢剛開始是華妃在管理。 在第一集裡， 太后和皇上在選秀的事情上大家明顯可以看到皇上和太后之間有矛盾， 許多事情皇上都是表面上同意太后的意思， 但內心裡卻是十分的不滿。 其實細心的網友看完整部甄嬛傳， 就會明白皇上是有多麼討厭太后和她身邊的人與物。
這皇上和太后之間有矛盾， 可是從小時候就有的， 當時太后生下雍正以後， 並沒有怎麼管他， 連給皇上唱童謠的願望太后都沒有滿足。 並且一直偏袒十四阿哥。 有三件事情足以證明皇上和太后矛盾之深。
第一件事情：太后和隆科多有私情
皇上選秀開始前， 太后和姑姑來到皇上這裡， 看到皇上整天政務繁忙， 有加上去後宮的日子不多， 說以讓他抓緊舉行選秀， 談完以後， 太后命姑姑端來一碗自己做的粥和醬菜， 當時皇上正吃著飯，
皇上聽到這句後臉色突然變了。 為何呢？其實後面的劇中給了答案。 皇上之所以聽到隆科多三字就心裡不爽， 原來是他和太后有私情， 當時隆科多和太后抱在一起的時候， 皇上剛好躲在簾子後面。 幼小的心裡從此蒙上一層揮之不去的陰影。 這也難怪皇上如此不悅， 額娘和自己的臣子有私情， 換做是誰心裡也不會舒服的。
第二件事情：沈眉莊的頭飾
沈眉莊和甄嬛是從小認識的一對好姐妹， 進宮以後她倆更是相扶相助。
大家看了都說好看，皇后還特意解釋了一番，沈眉莊當時也有身孕，太后就送了她這根簪子，上面有合二仙子示意多子多福和如意雙全之意，是太后在懷十四阿哥的時候戴著的，看到這大家也明白了，老十四畢竟和皇上爭奪過皇位，現在又被他關在大牢裡，對他是十分討厭。現在皇上聽到是關於老十四的往事，心情能高興嗎！
第三件事情：皇上廢後
皇后因為被甄嬛設計，讓甄嬛沒了孩子，皇上大發雷霆命令徹查此事。當時皇后被皇上叫來，問她關於純元皇后的事情。皇上是最喜歡純元的，知道自己面前的這個女人如此狠毒，連自己的姐姐也要害死，包括其她妃嬪和皇上的孩子她也不放過，決定要廢除她的皇后之位。但剛要下旨的時候，太后身邊的姑姑拿來太后的懿旨。皇上知道太后一直以來都是在極力的袒護著皇后，對太后已經極為不滿，明白這個懿旨肯定也是和廢後這件事情有關。就對姑姑說處理了皇后在聽。但姑姑說太后意思是烏拉那拉不可廢後。皇上心裡已經恨透了皇后，自己心愛的女人純元被皇后害死，最後沒辦法，皇后被囚居景仁宮，皇上與她死生不復相見。
大家看了都說好看，皇后還特意解釋了一番，沈眉莊當時也有身孕，太后就送了她這根簪子，上面有合二仙子示意多子多福和如意雙全之意，是太后在懷十四阿哥的時候戴著的，看到這大家也明白了，老十四畢竟和皇上爭奪過皇位，現在又被他關在大牢裡，對他是十分討厭。現在皇上聽到是關於老十四的往事，心情能高興嗎！
第三件事情：皇上廢後
皇后因為被甄嬛設計，讓甄嬛沒了孩子，皇上大發雷霆命令徹查此事。當時皇后被皇上叫來，問她關於純元皇后的事情。皇上是最喜歡純元的，知道自己面前的這個女人如此狠毒，連自己的姐姐也要害死，包括其她妃嬪和皇上的孩子她也不放過，決定要廢除她的皇后之位。但剛要下旨的時候，太后身邊的姑姑拿來太后的懿旨。皇上知道太后一直以來都是在極力的袒護著皇后，對太后已經極為不滿，明白這個懿旨肯定也是和廢後這件事情有關。就對姑姑說處理了皇后在聽。但姑姑說太后意思是烏拉那拉不可廢後。皇上心裡已經恨透了皇后，自己心愛的女人純元被皇后害死，最後沒辦法，皇后被囚居景仁宮，皇上與她死生不復相見。