漢陽鐵廠的興辦也存在一些問題。 管理與決策缺乏科學性是其重要的教訓之一。 當漢陽鐵廠已經開建， 煤鐵礦仍在勘查之中， 而且在鐵廠的經營中煤質問題一直是最大的困擾。 在工廠管理方面， 完全是衙門作風。 一幫閒職人員“終日酣嬉”， 無所事事。 以至於漢陽鐵廠開辦不久， “虧折甚巨”， 大量舉債， 張之洞也被折騰得“焦灼萬端”。
在無可奈何的情況下， 張之洞請長期經辦洋務的盛宣懷“招集商股， 官督商辦”。 1896年， 盛宣懷招股接辦了漢陽鐵廠以及“關涉鐵廠之鐵山、煤礦、運道、馬頭（碼頭）、輪駁各船”。 1908年， 盛宣懷奏准把漢陽鐵廠、萍鄉煤礦局、大冶鐵礦等合併擴充， 建立“漢冶萍煤鐵廠礦股份有限公司”， 簡稱“漢冶萍公司”。 至此， 它就成為“呈部註冊， 遵照奏定商律辦理”的商辦公司。
從1899年開始， 漢陽鐵廠的生鐵大量銷往日本八幡制鐵所。 1910年， 漢冶萍公司向美國西雅圖的西方鋼鐵公司銷售生鐵2萬噸。
漢冶萍公司仍然舉步維艱。 1908年， 與三井洋行簽訂100萬日元借款合同， 三井洋行取得漢陽鐵廠向國外銷售的特權， 並以生鐵作抵押。 1913年， 與日本制鐵所簽訂1500萬日元的借款合同， 以漢冶萍公司全部資產作抵押， 用頭等礦石和生鐵還款， 漢冶萍公司淪入日本制鐵所的實際控制中。 第一次世界大戰之後， 鋼鐵銷售的黃金時期消失， 漢冶萍公司因日債束縛， “每天應付利息， 約需二百數十萬元， 是公司之營業， 不啻專為債權者作嫁”， 漢陽鐵廠被迫於1924年10月停產。
漢陽鐵廠創建後的31年中， 共生產鐵221.4萬噸、鋼62.1萬噸， 1911年以前為全國鋼鐵總產量的100%。 從漢陽鐵廠到漢冶萍公司， 近代名噪一時的大型鋼鐵聯合企業在舊中國蹣跚前行。 1938年， 漢陽鐵廠拆遷到重慶建廠， 為今重慶鋼鐵集團的前身。