百合病的正治法，即所謂“見於陽者以陰法救之”，“見於陰者以陽法救之”。“見子陽”是指虛熱證，即陰虛內熱。主症是口苦，小便紅，脈微數。“以陰法救之”是用養陰清熱法來治療，方荊如百合地黃湯。“見於陰”是指虛寒證，即陽氣衰弱。主症是怕冷，四肢不溫，面色蒼白，脈沉細。這是百合病遷延日久，損傷陽氣，發展為陰陽兩虛的證候。“以陽法救之”是用甘溫扶陽為主的方法來治療，方劑如八味腎氣丸。
百合病病情比較複雜，如果粗心大意，就會發生誤診以至誤治。比如百合病口苦、小便紅，本是陰虛內熱，假如把虛熱誤認為實熱，採用攻下方法，這就是誤治。如因攻下無效，又用發汗法，這是一誤再誤。又如百合病拖延日久，出現怕冷，肢涼，本是陽虛所致，假如把虛寒誤認為表寒，採用發汗矗法，這也是誤治。如因發汗不見效，又用攻裡法，就是一誤再誤。
百台病誤用汗法，會出現心煩，舌紅，口乾渴等症。因為汗出過多，更加耗傷心肺的陰液，所以出現心煩，舌紅。陰愈虛，內熱就愈重，因而口中乾渴。在治療上應當加強清熱潤燥力量，用百台知母湯為主方。方中百合潤肺養心，知母清熱滋陰。同時可加天花粉生津止渴，生牡蠣引熱下行。
百合病誤用下法，會出現小便短紅而澀，呃逆或噁心嘔吐等症。誤下消耗陰液，內熱加重。所以小便短紅而澀。同時胃氣因誤下而受傷，胃氣上逆，所以艇逆、嘔惡。治法應當兼顧，既要養陰清熱，又要利小便，和胃降逆，用百合滑石代赭湯。百合養陰，滑石利小便而不傷陰，代赭石重鎮降逆而不傷脾胃。此方對百合病因誤下而引起的證侯是很恰當的。
百合病常見默默不語精神恍惚，想睡又睡不成等症，如果誤認為痰涎壅滯而誤用吐法，就會出現幹嘔，不思食，心悸不安、心煩失眠等等。這是因為誤吐損傷胃陰，訂失滋養，虛火上炎，所以幹嘔，不思食。特別是胃中虛火上炎，影響心神，因而心悸、心煩失眠。治法當滋陰安神，主方是百合雞予黃湯。雞子黃有滋養胃陰的作用，與百合相伍，能增強養心安神作用。茸合病的以上證候，除由誤吐引起外，也見於傷寒，痢疾以及久病氣陰受損之後。當患者在病中出現性格改變，說話多，無故啼笑，失眠，舌紅，脈虛數等等，用中西藥療效不顯，可按百台病虛火上炎、擾亂心神論治，用百合雞予黃湯為主方，能夠較快地政善病情。