三焦辨證認為上焦病（主要是肺病）不治即傳中焦胃與脾，肺病逆傳則見心包病變，中焦病不治則傳下焦肝與腎。病始于上焦，終結于下焦。因而可以用三焦來歸納，代表溫病發展過程中的證候類型，藉以說明疾病的演變經過和傳變規律。
上焦主要包括肺與心包的病變。溫病初起首先侵犯手太陰肺經，引起邪襲肺衛、肺氣失宣證，症見發熱微惡風寒，頭痛，咳嗽，無汗或少汗，口微渴，舌質邊尖紅赤，舌苔薄白，脈象浮數。甚則表現為溫邪壅肺、肺氣鬱閉證，症見發熱，咳喘，汗出，苔黃，脈滑數。若是肺經病變下傳中焦為順，如不下傳反而出現邪陷心包證候，如高熱，神志昏迷、譫語妄言，舌體轉動不是、言語不利、四肢厥冷等症則為逆傳。
中焦主要包括脾胃的病變。常見的證候類型有胃熱熾盛，津液不足證，症見壯熱、汗出、口渴飲冷、煩躁不安、舌苔黃燥、脈洪大或洪數等；腸道熱結、府氣不通證，症見發熱或傍晚發生潮熱，大便秘結數日不下，腹部脹滿疼痛拒按，舌苔黃燥或焦黃起刺，脈精數，或沉實，或沉遲有力，脾胃濕熱，氣機不暢證，症見惡寒，身熱逐漸增高，頭痛、頭暈，頭沉如有布裹，胸部憋悶，嘔惡不食，脘腹痞滿，便溏不爽，小便黃褐，面色垢暗，口中苦粘，嗜睡，神志呆板，舌苔白厚而膩，或白黃相兼，脈遲緩或濡緩。
下焦主要包括肝腎的病變。溫病傳入下焦必然傷害肝腎，出現肝腎真陰欲竭證，症見低熱、神呆，耳聾、手足心熱甚於手足背，日乾咽燥，心中悸動不寧，舌質絳幹枯萎，脈象虛細或有結代。甚者表現為陰血不足不能濡養筋脈，出現虛風內動證，症見筋脈拘急攣縮，伸展不利，手足蠕動、震顫、抽搐等徵象。