小兒風濕熱的發病原因尚不明確，一般認為與鏈球菌感染有密切關係，主要的根據如下：
1、患者在發病前1-3周常有溶血性鏈球菌感染病史，如咽炎、扁桃體炎或猩紅熱。
2、大多數小兒風濕熱患者的咽培養有A組β溶血性鏈球菌生長，或者血清中抗鏈球菌抗體顯著升高，如抗鏈球菌溶血素O等。
3、鏈球菌感染流行後小兒風濕熱的發病率增高。
4、應用青黴素治療或者預防溶血性鏈球菌感染，可防止小兒風濕熱的復發，甚至減少首次發病。
5、小兒風濕熱發病後用大劑量青黴素治療並不影響其病程，而且該病不是在鏈球菌感染的當時發病，而是感染後1-3周，所以大都認為小兒風濕熱的發病是由於鏈球菌感染引起的免疫反應。
6、鏈球菌細胞成分以及其菌外產物具有高度抗原性及特異性，人體感染鏈球菌後產生特異性抗體，這些抗體和抗原物質在結締組織內溶解，鏈球菌感染後抗體產生越多，發生小兒風濕熱的機會就越多。
7、小兒風濕熱患者的抗鏈球菌溶血素O或者其他鏈球菌抗體滴定度，比無併發症的鏈球菌感染患者多。