干擾素（IFN）是一種廣譜抗病毒劑，並不直接殺傷或抑制病毒，而主要是通過細胞表面受體作用使細胞產生抗病毒蛋白，從而抑制乙肝病毒的複製；同時還可增強自然殺傷細胞、巨噬細胞和T淋巴細胞的活力，從而起到免疫調節作用，並增強抗病毒能力。干擾素是目前用於乙肝抗病毒治療的常用藥物，但是使用干擾素常可導致乙肝患者發生下列不良反應：
全身反應
乙肝患者服用干擾素後的全身反應主要表現為流感樣症狀，即寒戰、發熱和不適。劑量超過44×104單位/m2時，注射2～6小時後即可出現發熱。隨著療程延長，發熱可逐漸減輕，一般7天后可停止發熱。為避免發熱，可使用醋氨酚，並在睡前注射IFNα，或在IFN的同時服用解熱鎮痛藥。
免疫抑制
主要表現為外周血白細胞和血小板減少。如中性粒細胞絕對計數≤0.75×109/L和（或）血小板﹤50×109/L，應降低IFNα劑量；1～2周後複查，如恢復，則逐漸增加至原量。如中性粒細胞絕對計數≤0.5×109/L和（或）血小板﹤30×109/L，則應停藥。
自身免疫性疾病
部分乙肝患者使用干擾素後可出現自身抗體，導致甲狀腺功能減退或亢進、糖尿病、血小板減少、牛皮癬、白斑、類風濕關節炎和系統性紅斑狼瘡樣綜合征等，應請相關科室醫師會診共同診治，嚴重者應停藥。
精神症狀
少量乙肝患者服用干擾素後可表現為抑鬱、妄想、重度焦慮等精神疾病症狀。對症狀嚴重者，應及時停用IFNα，必要時同神經精神科醫師進一步診治。