口腔盤狀紅斑狼瘡除了應與多形紅斑、扁平苔蘚相鑒別外，其口腔損害與天皰瘡、光化性唇炎、慢性唇炎的表現相似，因此應與這些疾病相鑒別。
1.天皰瘡：天皰瘡的口腔損害是廣泛累及口腔黏膜的水皰，有邊緣擴展現象；盤狀紅斑狼瘡病損為紅斑，病損局限，不具邊緣擴展現象。天皰瘡的皮損分佈於軀幹，尼氏征陽性；盤狀紅斑狼瘡的皮損主要分佈在面頰部，皮損尼氏征陰性，典型皮損是蝶形紅斑、盤形紅斑。天皰瘡的病理表現上皮內皰形成，可見天皰瘡細胞；盤狀紅斑狼瘡無上皮內皰形成。
2.光化性唇炎：急性光化性唇炎發病急，有近期暴曬史，唇紅黏膜廣泛充血、起皰、破潰、結痂，可伴有面部暴曬部位的紅斑、皮炎。病程一般2周左右。盤狀紅斑狼瘡發病緩慢，黏膜和皮膚的損害都是典型的盤狀紅斑，病程數月至數年。慢性光化性唇炎發病雖緩慢，但表現為唇紅部脫屑，黏膜象牙白樣改變，無盤狀紅斑出現。
3.慢性唇炎：慢性唇炎主要表現為唇組織腫脹，唇紅黏膜乾燥、脫屑、皸裂、糜爛、結痂。盤狀紅斑狼瘡少有皸裂發生。慢性唇炎無皮膚損害，盤狀紅斑狼瘡有典型皮損。