重症肌無力症開始表現為肌肉易疲勞，主要且最先出現的症狀在眼部。如患者早晨起床時還一切正常，幾十分鐘後，眼皮抬不起;但閉眼休息一會兒症狀又減輕;以後可能出現眼球活動不靈，並出現複視;休息後症狀會減輕。眼部症狀可能在雙側，但經常一側輕一側重;其他部位肌肉也可受到影響，如面部活動肌肉、咀嚼肌肉、吞咽肌肉及頸部肌肉，肩部、上肢均可受影響。症狀常在無意間逐漸出現並加重。
症狀有的可暫時減輕或緩解，並與病情惡化交替出現。感染、疲勞、精神刺激、月經、分娩等常使病情加重，可由局部逐漸波及全身。部分患者的症狀只限於眼部，影響患者最嚴重的是吞咽無力、進食困難;呼吸肌受害嚴重，因呼吸困難而危及生命。個別患者病情發展快，迅速惡化。也有一些患者在幾年或十多年後，症狀變化不大，病情會趨於穩定。