軀體化障礙主要的處理原則是幫助患者應對他們的軀體症狀。這種原則對有較多互相孤立存在的軀體主訴的人來說同樣適用。處理的目標不是即刻緩解症狀，而是幫助患者從慢性的功能障礙中康復。處理策略應根據每個人的特定問題而定，無法解釋的軀體主訴的處理原則包括：
1、一般處理
通常患者以前已在自己的經治醫生那裡進行了全面醫療檢查，可以排除潛在的軀體疾病。如沒有做過，則首先需要進行徹底的醫療檢查。根據所有的檢查結果和患者討論他們的症狀，如果沒有新的症狀或體征出現，複診是避免轉診給專科醫師。對軀體主訴的最好處理方法是患者定期地與經治醫師接觸。
2、心理治療
病人常常拒絕接受症狀的實質在於心理問題，故以提高認知為目的的心理治療可以説明病人探究並解決引起症狀的內心衝突。但有的病人對這種治療有阻抗。
軀體形式障礙需配合抗焦慮藥、抗抑鬱藥，而且要儘早使用。支持性心理治療、認知療法。精神動力療法。環境及家庭治療。針灸、理療是治療慢性疼痛行之有效的傳統方法。
軀體形式障礙的具體治療方法
（一）藥物治療
軀體形式障礙的病人常伴有焦慮、抑鬱、失眠等症狀，且與軀體症狀互為因果，形成惡性循環，單純的心理治療起效緩慢，需配合抗焦慮藥、抗抑鬱藥，而且要儘早使用。國內有報導阿米替林50～100mg/天，兩周內有效率達 88.8%，多慮平為87%。其療效機制大致有三種解釋：①通過緩解焦慮起效，但一般抗焦慮藥效果不顯著，只有三環類抗抑鬱劑效果明顯；②疼痛和軀體不適只不過是抑鬱症狀的一部分，抑鬱緩解後症狀也隨之消失；③有研究發現，感覺/疼痛閾的降低與5一HT的水準下降有關，三環類抗抑鬱劑可阻止5一HT的重吸收，因而提高了感覺閾值。
用抗抑鬱劑治療軀體形式障礙要注意以下幾點：①劑量要小，如阿米替林每天50 mg即可奏效，因藥物量大時副反應增加，避免病人誤認為軀體症狀加重；②為減輕副反應，加深睡眠，便於白天的活動，特別是在症狀好轉後可在睡前一次服用；③治療前必須講明藥物可能出現的副反應，如口幹、便秘、心悸等，以解除患者的擔心；④藥量要注意個體化。要強調治療有一個鞏固過程，其時間的長短取決於病程、個性和環境等因素。
（二）心理治療
1、支持性心理治療
建立良好的醫患關係是心理治療成敗的關鍵。本病患者除訴述眾多軀體症狀外，還有著漫長而無甚效果的就診經歷，情緒緊張而焦慮。醫生要特別有耐心傾聽患者的傾訴，對患者表示關心、理解和同情，讓患者對醫生產生信任，對治療抱有希望。
在治療過程中醫生的接觸技巧至關重要。患者常表現依賴性、表演性及受到傷害的疾病行為，好抱怨或感到委屈。有的患者沉湎于痛苦中，習慣於對藥物的依賴，有的甚至帶有敵意或威脅，使治療者處於被動地位或缺乏信心。醫生既要對患者的痛苦表示同情和理解，又要引導患者將注意力集中在既定的治療目標和已獲得的成果上，如睡眠改善、疼痛的減輕等。要勉勵病人將輕微的軀體不適如同正常感知的一部分，並與之和平相處。宜逐漸增加活動量，儘量減少不必要的藥物。當藥物治療無效時心理治療更為重要。主要採取系統、個別的短程面談的方式，每次至少20分鐘，療程約3個月。治療的目的在於讓患者認識到不良疾病行為，分析引發疾病的有關因素，共同尋找解決問題的方法，建立對生活事件及軀體病痛的正確態度。
2、認知療法
首先要讓患者認識到，雖然病痛是他真實的感受，但並不存在器質生病變，對生命、健康不會帶來任何威脅，要糾正錯誤的認知，重見正確的疾病概念和對待疾病的態度，學會與症狀共存，要轉移注意，儘量忽視它，並鼓勵患者參加力所能及的勞動。
3、精神動力療法
精神動力學派認為慢性心因性疼痛是一種情緒的反應，象徵著患者好鬥性的昇華或失去心愛物的反應，疼痛能使壓抑的內心找到寄託。幫助病人探究並領悟症狀背後的內在的心理衝突，對症狀的緩解有效。
4、環境及家庭治療
調整患者所處的環境對矯正疾病行為、發展健康行為至關重要。醫生要協助病人增強對社會環境和家庭的適應能力，鼓勵病人努力學會自我調節，儘早擺脫依賴性。其配偶和親友對病人的疾病和痛苦要給予充分的理解和同情，改變消極、冷漠、歧視的態度，建立積極、關心、幫助的家庭氛圍。有研究表明，短期或長期家庭治療對改善患者的人際關係是十分有效的。
5、催眠暗示療法
對某些暗示性較強的患者有短暫療效，一般認為單用催眠治療效果不大，療效也不持久。
（三）其他治療
針灸、理療是治療慢性疼痛行之有效的傳統方法。有研究證明，針灸對4/5的慢性疼痛病人有效，經對照研究證明，皮神經刺激術不僅可起安慰、暗示效應，低頻率刺激可通過內啡肽，高頻率刺激通過5一HT起作用。保健氣功鍛煉是一種自我調節和放鬆訓練的好方法，可用於治療焦慮症狀明顯的患者。