再生障礙性貧血簡稱再障，是由多種病因引起的以造血肝細胞數量減少和功能缺陷為主的造血障礙。再生障礙性貧血的常見病因包括藥物、病毒感染、長期接觸放射線、化學毒物、免疫因素等。
藥物引發的再生障礙性貧血與藥物劑量有關，即再生障礙性貧血為藥物的毒性作用，當某些藥物的使用劑量達到一定劑量時，就會引起骨髓抑制，長期的骨髓抑制就可能引發再生障礙性貧血。常見可能引發疾病的藥物包括甲氨蝶呤、白消安、雌激素、苯妥英鈉等。部分患者對於某種藥物具有特異性反應，而與藥物劑量無關，最常見的藥物就是氯黴素，其他藥物還包括保泰松、有機砷、氨基比林、磺胺等。
某些病毒感染可能引發再生障礙性貧血，其機理與機體自身免疫有關，常見病毒感染為肝炎病毒，微小病毒等。
長期接觸X光線、放射性核素、化學毒物等都可能影響染色體的複製、抑制細胞有絲分裂，干擾骨髓細胞生成，抑制骨髓細胞分化，造血肝細胞數量減少，而引發再生障礙性貧血。
免疫因素也是導致再障的重要因素，再障可繼發於自身免疫性疾病，患者血清中可以找到抑制造血幹細胞的抗體。