造血幹細胞移植是治療再生障礙性貧血的有效方法，無論是骨髓幹細胞移植還是臍帶血幹細胞移植，在手術前都需要找到配型成功的合適幹細胞捐贈者。只有供者的造血幹細胞與受者相配才能進行移植，供者和受者之間越匹配，移植成功幾率越大。
判斷供者和受者是否匹配的過程稱為配型，造血幹細胞移植配型主要是判斷組織相容性基因的匹配程度。HLA基因主要有A、B、C、D四個點，D點中還有DP、DQ、DR三個點。所以一共有6個位點。異體臍帶血幹細胞、異體骨髓移植中，只有這些點相同才不產生排斥反應。每個人HLA基因有2條，分別來自父母，故子代和父母之間總有一條是相同的，即HLA基因半相同。兄弟姐妹之間有一半的機會HLA基因半相同，四分之一的機會完全相同。因此再生障礙性貧血患者如果有親兄弟姐妹，有四分之一的機會完全相同。相同的人就可以當作造血幹細胞供者。無兄弟姐妹的患者可從骨髓庫中尋找。
再障患者能否找到HLA相合的血緣無關供者與查找骨髓庫大小、患者原發病情況、患者原發病情況等因素有關。