造血幹細胞移植是再生障礙性貧血患者康復的希望，配型成功的造血幹細胞移植也不一定會完全移植成功，移植手術的每一個步驟都關係著手術的成敗。清髓性預處理方案是再生障礙性貧血患者進行造血幹細胞移植前常用的預處理方案，預處理效果的好壞直接影響著幹細胞抑制的成敗。
清髓性預處理方案按是否含全身照射，分為含全身照射的預處理方案和不含全身照射的預處理方案。全身照射不僅具有強烈的免疫抑制作用，而且隨全身照射劑量的增加，對造血系統殘餘血細胞和骨髓內異常細胞的殺傷能力也顯著增加。全身照射常與化療藥物合用，常用藥物包括環磷醯胺、阿糖胞苷、足葉乙甙、馬法蘭等。
由於全身照射不僅近期毒副作用較大，而且其遠期毒副作用，如白內障、性腺受損、繼發性腫瘤及兒童生長發育遲緩等，嚴重影響長期生存者的生活品質。因此不含全身照射的聯合化療預處理方案更容易被患者接受。應用不含全身照射的預處理方案不需要放療等特殊設備，常用的化療藥物包括氮芥、足葉乙甙、馬法蘭、卡鉑、順鉑等藥物。