骨髓移植是治療再生障礙性貧血的有效方法之一，再生障礙性貧血患者植入健康人的骨髓，利用骨髓中能夠產生血液和免疫細胞的幹細胞而重建自身造血系統。骨髓移植是所有移植手術中最嚴格的一種，移植供體和受體二者之間的配型要求極高，需要HLA完全相合才能進行移植。因此尋找配型符合要求的骨髓移植供者相當困難，同胞之間僅有四分之一的機會配型成功，而非親屬之間的配型成功率僅為十萬分之一。骨髓移植患者常因排斥反應而導致移植失敗。
相對於骨髓移植，臍帶血幹細胞移植時HLA不需要完全相合，這使同胞之間、近親屬之間，甚至非親屬之間的配型成功率也大為增加，同胞之間的配型成功率可以高達75%。臍帶血移植過程簡便，臍帶血的採集對於產婦和新生兒都無任何影響。臍帶血移植後較少發生排斥反應，程度也較輕微。
相對骨髓移植，臍帶血幹細胞移植所引發的後遺症更少，而且幹細胞的排斥機率也較低。因此臍帶血幹細胞可以取代骨髓用於治療各種血液、免疫及代謝方面的多種疾病。