傳統的西醫治療方法有手術和藥物兩種：
一是藥物治療，主要是口服激素，即假孕和假絕經療法，就是人為的造成閉經和絕經，這會帶來很多的副作用，引起肝腎功能的損傷，另外，一旦停了藥以後，復發率很高，而且停了藥還會反彈，所謂反彈，就拿痛經來說，吃藥以前痛經，停了藥以後反而痛得更厲害，而卵巢囊腫反而生長的速度比用藥以前還要快，
二是手術治療，手術治療包括保守治療、半根治治療和根治治療，保守治療是保留生育功能，只把子宮內膜異位的病灶結節切除掉，恢復它正常的解剖生理功能，使患者能夠懷孕，半根治手術治療就是切除子宮、一側卵巢和全部的盆腔內的子宮內膜異位病灶，但也是又復發率的，根治性手術是切除子宮、雙側卵巢但會造成更年期綜合症，嚴重的影響女性朋友的生活品質。
針對子宮內膜異位症的患者，那日常的症膳食原則為：
1、肥厚油膩，易於滯瘀，少食為好。清淡疏利之品較為適宜。
2、忌一切寒涼食品。行經前後，尤須注意進食過熱的湯、菜，生冷食物均屬禁忌。
3、多食用補虛益氣食品。可以助氣行血，能有緩解疼痛之效。氣血虛少者尤為適宜。
4、酸澀收斂之品，易導致瘀氣滯血，應予避免。辛溫發散，利於行通，可食：但不宜過多，因辛辣刺激過甚，疼痛亦會加重。