系統性紅斑狼瘡是一個多系統損害的疾病。正因為它損害多個臟器、器官，所以它的表現也是千變萬化的，有的病人以這樣的表現為主，而有些病人則以另外的表現為特徵，這就給系統性紅斑狼瘡的診斷造成了極大的困難。
但對於任何一個疾病，無論病情多麼複雜，它總會有一些特殊的表現，紅斑狼瘡也是如此。經過許許多多，甚至是幾代醫學科技工作者的觀察，制訂出了有關系統紅斑狼瘡的診斷標準。一般來說，當病人出現下列症狀中的4項以上時，可高度懷疑系統性紅斑狼瘡的可能。
◎面部出現像“蝴蝶”樣的紅斑。
◎皮膚上出現像盤子狀的紅斑。
◎皮疹（紅斑）經陽光、紫外線等照射會加重中。
◎有反復發作的口腔潰瘍，但無疼痛感。
◎有癲癇或其他神經病的表現。
◎有胸悶、氣喘，經醫生診斷懷疑有胸膜炎或心包炎。
◎有關節疼痛，類似於關節炎。
◎化驗尿常規，可見有尿蛋白。
◎化驗血常規，可見有白細胞、血小板或血紅蛋白減少。
◎特殊的血液學化驗可見：抗核抗體陽性，抗雙鏈DNA抗體陽性，抗Sm抗體陽性等。
◎化驗免疫球蛋白及血清補體可見部分免疫球蛋白異常，血清補體下降。
◎有不明原因的發熱。
對於不典型的系統性紅斑狼瘡診斷比較困難。確定診斷可能需要數月的觀察，進行多項化驗檢查，有時需要藥物試驗性治療。因為許多症狀各具特色，有時會誤以為其他疾病。